Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR59

Gadd45gip1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45gip1Q9CR59 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gadd45gip1Q9CR59 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gadd45gip1Q9CR59 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gadd45gip1Q9CR59 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gadd45gip1Q9CR59 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gadd45gip1Q9CR59 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gadd45gip1Q9CR59 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gadd45gip1Q9CR59 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gadd45gip1Q9CR59 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gadd45gip1Q9CR59 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gadd45gip1Q9CR59 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gadd45gip1Q9CR59 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gadd45gip1Q9CR59 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gadd45gip1Q9CR59 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gadd45gip1Q9CR59 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gadd45gip1Q9CR59 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gadd45gip1Q9CR59 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gadd45gip1Q9CR59 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gadd45gip1Q9CR59 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gadd45gip1Q9CR59 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gadd45gip1Q9CR59 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gadd45gip1Q9CR59 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gadd45gip1Q9CR59 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gadd45gip1Q9CR59 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gadd45gip1Q9CR59 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gadd45gip1Q9CR59 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gadd45gip1Q9CR59 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gadd45gip1Q9CR59 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gadd45gip1Q9CR59 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gadd45gip1Q9CR59 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gadd45gip1Q9CR59 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms