Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn8Q9Z260 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn8Q9Z260 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn8Q9Z260 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cldn8Q9Z260 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cldn8Q9Z260 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn8Q9Z260 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn8Q9Z260 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn8Q9Z260 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn8Q9Z260 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn8Q9Z260 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn8Q9Z260 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn8Q9Z260 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn8Q9Z260 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn8Q9Z260 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn8Q9Z260 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn8Q9Z260 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn8Q9Z260 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn8Q9Z260 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn8Q9Z260 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn8Q9Z260 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn8Q9Z260 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn8Q9Z260 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn8Q9Z260 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn8Q9Z260 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn8Q9Z260 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn8Q9Z260 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn8Q9Z260 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn8Q9Z260 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn8Q9Z260 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn8Q9Z260 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn8Q9Z260 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn8Q9Z260 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn8Q9Z260 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn8Q9Z260 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn8Q9Z260 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn8Q9Z260 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn8Q9Z260 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn8Q9Z260 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn8Q9Z260 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn8Q9Z260 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn8Q9Z260 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn8Q9Z260 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn8Q9Z260 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn8Q9Z260 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn8Q9Z260 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn8Q9Z260 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn8Q9Z260 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn8Q9Z260 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn8Q9Z260 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn8Q9Z260 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn8Q9Z260 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn8Q9Z260 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn8Q9Z260 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn8Q9Z260 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn8Q9Z260 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn8Q9Z260 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cldn8Q9Z260 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn8Q9Z260 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn8Q9Z260 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn8Q9Z260 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn8Q9Z260 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn8Q9Z260 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn8Q9Z260 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn8Q9Z260 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn8Q9Z260 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn8Q9Z260 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn8Q9Z260 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn8Q9Z260 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn8Q9Z260 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn8Q9Z260 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn8Q9Z260 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn8Q9Z260 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn8Q9Z260 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn8Q9Z260 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn8Q9Z260 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn8Q9Z260 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn8Q9Z260 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn8Q9Z260 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn8Q9Z260 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cldn8Q9Z260 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn8Q9Z260 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn8Q9Z260 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn8Q9Z260 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn8Q9Z260 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn8Q9Z260 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn8Q9Z260 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn8Q9Z260 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn8Q9Z260 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn8Q9Z260 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn8Q9Z260 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn8Q9Z260 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn8Q9Z260 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn8Q9Z260 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn8Q9Z260 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn8Q9Z260 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn8Q9Z260 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn8Q9Z260 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn8Q9Z260 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn8Q9Z260 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.3 ms