Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccne2Q9Z238 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccne2Q9Z238 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccne2Q9Z238 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccne2Q9Z238 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccne2Q9Z238 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccne2Q9Z238 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccne2Q9Z238 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccne2Q9Z238 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccne2Q9Z238 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ccne2Q9Z238 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccne2Q9Z238 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccne2Q9Z238 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccne2Q9Z238 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccne2Q9Z238 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccne2Q9Z238 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccne2Q9Z238 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccne2Q9Z238 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccne2Q9Z238 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccne2Q9Z238 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccne2Q9Z238 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccne2Q9Z238 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccne2Q9Z238 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccne2Q9Z238 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccne2Q9Z238 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccne2Q9Z238 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccne2Q9Z238 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccne2Q9Z238 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccne2Q9Z238 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccne2Q9Z238 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccne2Q9Z238 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccne2Q9Z238 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccne2Q9Z238 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccne2Q9Z238 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccne2Q9Z238 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccne2Q9Z238 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccne2Q9Z238 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccne2Q9Z238 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccne2Q9Z238 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccne2Q9Z238 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccne2Q9Z238 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccne2Q9Z238 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccne2Q9Z238 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccne2Q9Z238 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccne2Q9Z238 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccne2Q9Z238 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccne2Q9Z238 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccne2Q9Z238 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccne2Q9Z238 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccne2Q9Z238 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccne2Q9Z238 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccne2Q9Z238 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccne2Q9Z238 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccne2Q9Z238 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ccne2Q9Z238 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ccne2Q9Z238 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccne2Q9Z238 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccne2Q9Z238 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccne2Q9Z238 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccne2Q9Z238 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccne2Q9Z238 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccne2Q9Z238 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccne2Q9Z238 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccne2Q9Z238 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccne2Q9Z238 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccne2Q9Z238 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccne2Q9Z238 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccne2Q9Z238 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccne2Q9Z238 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccne2Q9Z238 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccne2Q9Z238 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccne2Q9Z238 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccne2Q9Z238 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccne2Q9Z238 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccne2Q9Z238 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccne2Q9Z238 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccne2Q9Z238 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccne2Q9Z238 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccne2Q9Z238 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccne2Q9Z238 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccne2Q9Z238 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccne2Q9Z238 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccne2Q9Z238 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccne2Q9Z238 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccne2Q9Z238 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccne2Q9Z238 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccne2Q9Z238 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccne2Q9Z238 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccne2Q9Z238 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccne2Q9Z238 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccne2Q9Z238 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccne2Q9Z238 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccne2Q9Z238 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccne2Q9Z238 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccne2Q9Z238 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccne2Q9Z238 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccne2Q9Z238 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccne2Q9Z238 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccne2Q9Z238 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccne2Q9Z238 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 226.4 ms