Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W9

Stk39, STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk39Q9Z1W9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Stk39Q9Z1W9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Stk39Q9Z1W9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Stk39Q9Z1W9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Stk39Q9Z1W9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Stk39Q9Z1W9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Stk39Q9Z1W9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Stk39Q9Z1W9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Stk39Q9Z1W9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Stk39Q9Z1W9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Stk39Q9Z1W9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Stk39Q9Z1W9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Stk39Q9Z1W9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Stk39Q9Z1W9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Stk39Q9Z1W9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Stk39Q9Z1W9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Stk39Q9Z1W9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Stk39Q9Z1W9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Stk39Q9Z1W9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Stk39Q9Z1W9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Stk39Q9Z1W9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Stk39Q9Z1W9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Stk39Q9Z1W9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Stk39Q9Z1W9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Stk39Q9Z1W9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Stk39Q9Z1W9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Stk39Q9Z1W9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Stk39Q9Z1W9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Stk39Q9Z1W9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Stk39Q9Z1W9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Stk39Q9Z1W9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Stk39Q9Z1W9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Stk39Q9Z1W9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Stk39Q9Z1W9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Stk39Q9Z1W9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Stk39Q9Z1W9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Stk39Q9Z1W9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Stk39Q9Z1W9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Stk39Q9Z1W9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Stk39Q9Z1W9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Stk39Q9Z1W9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Stk39Q9Z1W9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Stk39Q9Z1W9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Stk39Q9Z1W9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stk39Q9Z1W9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stk39Q9Z1W9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stk39Q9Z1W9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stk39Q9Z1W9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Stk39Q9Z1W9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stk39Q9Z1W9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Stk39Q9Z1W9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Stk39Q9Z1W9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Stk39Q9Z1W9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stk39Q9Z1W9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stk39Q9Z1W9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stk39Q9Z1W9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stk39Q9Z1W9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stk39Q9Z1W9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stk39Q9Z1W9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stk39Q9Z1W9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stk39Q9Z1W9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stk39Q9Z1W9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stk39Q9Z1W9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stk39Q9Z1W9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Stk39Q9Z1W9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stk39Q9Z1W9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stk39Q9Z1W9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Stk39Q9Z1W9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Stk39Q9Z1W9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Stk39Q9Z1W9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Stk39Q9Z1W9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Stk39Q9Z1W9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Stk39Q9Z1W9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Stk39Q9Z1W9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Stk39Q9Z1W9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Stk39Q9Z1W9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Stk39Q9Z1W9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Stk39Q9Z1W9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Stk39Q9Z1W9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Stk39Q9Z1W9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Stk39Q9Z1W9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Stk39Q9Z1W9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Stk39Q9Z1W9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Stk39Q9Z1W9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Stk39Q9Z1W9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Stk39Q9Z1W9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Stk39Q9Z1W9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Stk39Q9Z1W9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Stk39Q9Z1W9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Stk39Q9Z1W9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Stk39Q9Z1W9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Stk39Q9Z1W9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Stk39Q9Z1W9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Stk39Q9Z1W9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Stk39Q9Z1W9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Stk39Q9Z1W9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Stk39Q9Z1W9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Stk39Q9Z1W9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Stk39Q9Z1W9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Stk39Q9Z1W9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms