Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q5

Clic1, Chloride intracellular channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic1Q9Z1Q5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clic1Q9Z1Q5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Clic1Q9Z1Q5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clic1Q9Z1Q5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clic1Q9Z1Q5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clic1Q9Z1Q5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clic1Q9Z1Q5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clic1Q9Z1Q5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clic1Q9Z1Q5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clic1Q9Z1Q5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clic1Q9Z1Q5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clic1Q9Z1Q5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clic1Q9Z1Q5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clic1Q9Z1Q5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clic1Q9Z1Q5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clic1Q9Z1Q5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clic1Q9Z1Q5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clic1Q9Z1Q5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clic1Q9Z1Q5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clic1Q9Z1Q5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clic1Q9Z1Q5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clic1Q9Z1Q5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clic1Q9Z1Q5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clic1Q9Z1Q5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clic1Q9Z1Q5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clic1Q9Z1Q5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clic1Q9Z1Q5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clic1Q9Z1Q5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clic1Q9Z1Q5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Clic1Q9Z1Q5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clic1Q9Z1Q5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Clic1Q9Z1Q5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clic1Q9Z1Q5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clic1Q9Z1Q5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clic1Q9Z1Q5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Clic1Q9Z1Q5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clic1Q9Z1Q5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clic1Q9Z1Q5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clic1Q9Z1Q5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clic1Q9Z1Q5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clic1Q9Z1Q5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clic1Q9Z1Q5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clic1Q9Z1Q5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clic1Q9Z1Q5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clic1Q9Z1Q5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clic1Q9Z1Q5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clic1Q9Z1Q5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clic1Q9Z1Q5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clic1Q9Z1Q5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Clic1Q9Z1Q5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clic1Q9Z1Q5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clic1Q9Z1Q5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clic1Q9Z1Q5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clic1Q9Z1Q5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clic1Q9Z1Q5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clic1Q9Z1Q5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clic1Q9Z1Q5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clic1Q9Z1Q5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clic1Q9Z1Q5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clic1Q9Z1Q5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clic1Q9Z1Q5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clic1Q9Z1Q5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clic1Q9Z1Q5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clic1Q9Z1Q5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clic1Q9Z1Q5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clic1Q9Z1Q5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clic1Q9Z1Q5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clic1Q9Z1Q5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Clic1Q9Z1Q5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clic1Q9Z1Q5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clic1Q9Z1Q5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clic1Q9Z1Q5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clic1Q9Z1Q5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clic1Q9Z1Q5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clic1Q9Z1Q5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clic1Q9Z1Q5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clic1Q9Z1Q5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Clic1Q9Z1Q5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Clic1Q9Z1Q5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clic1Q9Z1Q5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clic1Q9Z1Q5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clic1Q9Z1Q5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clic1Q9Z1Q5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clic1Q9Z1Q5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clic1Q9Z1Q5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clic1Q9Z1Q5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Clic1Q9Z1Q5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clic1Q9Z1Q5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clic1Q9Z1Q5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clic1Q9Z1Q5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Clic1Q9Z1Q5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clic1Q9Z1Q5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clic1Q9Z1Q5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clic1Q9Z1Q5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clic1Q9Z1Q5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clic1Q9Z1Q5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clic1Q9Z1Q5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clic1Q9Z1Q5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clic1Q9Z1Q5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clic1Q9Z1Q5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms