Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfkbiaQ9Z1E3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfkbiaQ9Z1E3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfkbiaQ9Z1E3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NfkbiaQ9Z1E3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NfkbiaQ9Z1E3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NfkbiaQ9Z1E3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NfkbiaQ9Z1E3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NfkbiaQ9Z1E3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NfkbiaQ9Z1E3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NfkbiaQ9Z1E3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NfkbiaQ9Z1E3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NfkbiaQ9Z1E3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NfkbiaQ9Z1E3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NfkbiaQ9Z1E3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NfkbiaQ9Z1E3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NfkbiaQ9Z1E3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NfkbiaQ9Z1E3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NfkbiaQ9Z1E3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfkbiaQ9Z1E3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfkbiaQ9Z1E3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfkbiaQ9Z1E3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfkbiaQ9Z1E3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NfkbiaQ9Z1E3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NfkbiaQ9Z1E3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NfkbiaQ9Z1E3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NfkbiaQ9Z1E3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NfkbiaQ9Z1E3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NfkbiaQ9Z1E3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NfkbiaQ9Z1E3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NfkbiaQ9Z1E3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NfkbiaQ9Z1E3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NfkbiaQ9Z1E3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NfkbiaQ9Z1E3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NfkbiaQ9Z1E3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NfkbiaQ9Z1E3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NfkbiaQ9Z1E3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NfkbiaQ9Z1E3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NfkbiaQ9Z1E3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NfkbiaQ9Z1E3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NfkbiaQ9Z1E3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NfkbiaQ9Z1E3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NfkbiaQ9Z1E3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NfkbiaQ9Z1E3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NfkbiaQ9Z1E3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NfkbiaQ9Z1E3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NfkbiaQ9Z1E3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NfkbiaQ9Z1E3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NfkbiaQ9Z1E3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NfkbiaQ9Z1E3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NfkbiaQ9Z1E3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NfkbiaQ9Z1E3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NfkbiaQ9Z1E3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NfkbiaQ9Z1E3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NfkbiaQ9Z1E3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NfkbiaQ9Z1E3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NfkbiaQ9Z1E3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NfkbiaQ9Z1E3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NfkbiaQ9Z1E3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NfkbiaQ9Z1E3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NfkbiaQ9Z1E3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NfkbiaQ9Z1E3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NfkbiaQ9Z1E3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NfkbiaQ9Z1E3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NfkbiaQ9Z1E3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NfkbiaQ9Z1E3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NfkbiaQ9Z1E3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NfkbiaQ9Z1E3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NfkbiaQ9Z1E3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NfkbiaQ9Z1E3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NfkbiaQ9Z1E3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NfkbiaQ9Z1E3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfkbiaQ9Z1E3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfkbiaQ9Z1E3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfkbiaQ9Z1E3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfkbiaQ9Z1E3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfkbiaQ9Z1E3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NfkbiaQ9Z1E3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NfkbiaQ9Z1E3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NfkbiaQ9Z1E3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NfkbiaQ9Z1E3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NfkbiaQ9Z1E3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NfkbiaQ9Z1E3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NfkbiaQ9Z1E3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NfkbiaQ9Z1E3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NfkbiaQ9Z1E3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NfkbiaQ9Z1E3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NfkbiaQ9Z1E3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfkbiaQ9Z1E3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfkbiaQ9Z1E3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfkbiaQ9Z1E3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfkbiaQ9Z1E3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfkbiaQ9Z1E3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120 ms