Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cog1Q9Z160 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cog1Q9Z160 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cog1Q9Z160 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cog1Q9Z160 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cog1Q9Z160 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cog1Q9Z160 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cog1Q9Z160 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cog1Q9Z160 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cog1Q9Z160 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cog1Q9Z160 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cog1Q9Z160 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cog1Q9Z160 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cog1Q9Z160 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cog1Q9Z160 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cog1Q9Z160 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cog1Q9Z160 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cog1Q9Z160 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cog1Q9Z160 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cog1Q9Z160 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cog1Q9Z160 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cog1Q9Z160 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cog1Q9Z160 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cog1Q9Z160 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cog1Q9Z160 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cog1Q9Z160 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cog1Q9Z160 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cog1Q9Z160 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cog1Q9Z160 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cog1Q9Z160 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cog1Q9Z160 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cog1Q9Z160 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cog1Q9Z160 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cog1Q9Z160 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cog1Q9Z160 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cog1Q9Z160 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cog1Q9Z160 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cog1Q9Z160 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cog1Q9Z160 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cog1Q9Z160 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cog1Q9Z160 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cog1Q9Z160 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cog1Q9Z160 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cog1Q9Z160 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cog1Q9Z160 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cog1Q9Z160 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cog1Q9Z160 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cog1Q9Z160 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cog1Q9Z160 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cog1Q9Z160 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cog1Q9Z160 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cog1Q9Z160 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cog1Q9Z160 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cog1Q9Z160 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cog1Q9Z160 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cog1Q9Z160 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cog1Q9Z160 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cog1Q9Z160 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cog1Q9Z160 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cog1Q9Z160 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cog1Q9Z160 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cog1Q9Z160 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cog1Q9Z160 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cog1Q9Z160 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cog1Q9Z160 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cog1Q9Z160 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cog1Q9Z160 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cog1Q9Z160 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cog1Q9Z160 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cog1Q9Z160 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cog1Q9Z160 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cog1Q9Z160 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cog1Q9Z160 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cog1Q9Z160 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cog1Q9Z160 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cog1Q9Z160 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cog1Q9Z160 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cog1Q9Z160 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cog1Q9Z160 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cog1Q9Z160 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cog1Q9Z160 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cog1Q9Z160 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cog1Q9Z160 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cog1Q9Z160 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cog1Q9Z160 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cog1Q9Z160 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cog1Q9Z160 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cog1Q9Z160 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cog1Q9Z160 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cog1Q9Z160 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cog1Q9Z160 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cog1Q9Z160 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cog1Q9Z160 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cog1Q9Z160 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cog1Q9Z160 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cog1Q9Z160 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cog1Q9Z160 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cog1Q9Z160 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cog1Q9Z160 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cog1Q9Z160 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms