Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUF1

Vmn1r49, Vomeronasal type-1 receptor 49, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r49Q9WUF1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r49Q9WUF1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r49Q9WUF1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r49Q9WUF1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r49Q9WUF1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r49Q9WUF1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r49Q9WUF1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r49Q9WUF1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r49Q9WUF1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r49Q9WUF1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r49Q9WUF1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r49Q9WUF1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r49Q9WUF1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r49Q9WUF1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r49Q9WUF1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r49Q9WUF1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r49Q9WUF1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r49Q9WUF1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r49Q9WUF1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r49Q9WUF1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r49Q9WUF1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r49Q9WUF1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r49Q9WUF1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r49Q9WUF1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r49Q9WUF1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r49Q9WUF1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r49Q9WUF1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms