Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUF1

Vmn1r49, Vomeronasal type-1 receptor 49, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r49Q9WUF1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r49Q9WUF1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r49Q9WUF1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r49Q9WUF1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r49Q9WUF1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r49Q9WUF1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r49Q9WUF1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r49Q9WUF1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r49Q9WUF1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r49Q9WUF1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r49Q9WUF1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r49Q9WUF1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r49Q9WUF1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r49Q9WUF1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r49Q9WUF1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r49Q9WUF1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r49Q9WUF1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r49Q9WUF1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r49Q9WUF1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r49Q9WUF1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r49Q9WUF1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r49Q9WUF1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r49Q9WUF1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r49Q9WUF1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r49Q9WUF1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r49Q9WUF1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r49Q9WUF1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r49Q9WUF1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r49Q9WUF1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.7 ms