Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTN0

Ggps1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggps1Q9WTN0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ggps1Q9WTN0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ggps1Q9WTN0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ggps1Q9WTN0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ggps1Q9WTN0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ggps1Q9WTN0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ggps1Q9WTN0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ggps1Q9WTN0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ggps1Q9WTN0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ggps1Q9WTN0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ggps1Q9WTN0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ggps1Q9WTN0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ggps1Q9WTN0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ggps1Q9WTN0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ggps1Q9WTN0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ggps1Q9WTN0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ggps1Q9WTN0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ggps1Q9WTN0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ggps1Q9WTN0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ggps1Q9WTN0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ggps1Q9WTN0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ggps1Q9WTN0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ggps1Q9WTN0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ggps1Q9WTN0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ggps1Q9WTN0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ggps1Q9WTN0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ggps1Q9WTN0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ggps1Q9WTN0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ggps1Q9WTN0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ggps1Q9WTN0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ggps1Q9WTN0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ggps1Q9WTN0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ggps1Q9WTN0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ggps1Q9WTN0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ggps1Q9WTN0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ggps1Q9WTN0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ggps1Q9WTN0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ggps1Q9WTN0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ggps1Q9WTN0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ggps1Q9WTN0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ggps1Q9WTN0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ggps1Q9WTN0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ggps1Q9WTN0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ggps1Q9WTN0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ggps1Q9WTN0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ggps1Q9WTN0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ggps1Q9WTN0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ggps1Q9WTN0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ggps1Q9WTN0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ggps1Q9WTN0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ggps1Q9WTN0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ggps1Q9WTN0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ggps1Q9WTN0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ggps1Q9WTN0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ggps1Q9WTN0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ggps1Q9WTN0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ggps1Q9WTN0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ggps1Q9WTN0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ggps1Q9WTN0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ggps1Q9WTN0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ggps1Q9WTN0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ggps1Q9WTN0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ggps1Q9WTN0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ggps1Q9WTN0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ggps1Q9WTN0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ggps1Q9WTN0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ggps1Q9WTN0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ggps1Q9WTN0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ggps1Q9WTN0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ggps1Q9WTN0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ggps1Q9WTN0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ggps1Q9WTN0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ggps1Q9WTN0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ggps1Q9WTN0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ggps1Q9WTN0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ggps1Q9WTN0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ggps1Q9WTN0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ggps1Q9WTN0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ggps1Q9WTN0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ggps1Q9WTN0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ggps1Q9WTN0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ggps1Q9WTN0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ggps1Q9WTN0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ggps1Q9WTN0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ggps1Q9WTN0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ggps1Q9WTN0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ggps1Q9WTN0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ggps1Q9WTN0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ggps1Q9WTN0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ggps1Q9WTN0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ggps1Q9WTN0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ggps1Q9WTN0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ggps1Q9WTN0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ggps1Q9WTN0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ggps1Q9WTN0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ggps1Q9WTN0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ggps1Q9WTN0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ggps1Q9WTN0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ggps1Q9WTN0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ggps1Q9WTN0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms