Protein–RNA interactions for Protein: Q9R100

Cdh17, Cadherin-17, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh17Q9R100 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh17Q9R100 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh17Q9R100 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh17Q9R100 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh17Q9R100 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh17Q9R100 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh17Q9R100 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh17Q9R100 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh17Q9R100 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh17Q9R100 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh17Q9R100 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh17Q9R100 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh17Q9R100 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh17Q9R100 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh17Q9R100 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh17Q9R100 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh17Q9R100 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh17Q9R100 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh17Q9R100 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh17Q9R100 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh17Q9R100 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh17Q9R100 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh17Q9R100 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh17Q9R100 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh17Q9R100 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh17Q9R100 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh17Q9R100 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh17Q9R100 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh17Q9R100 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh17Q9R100 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh17Q9R100 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh17Q9R100 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh17Q9R100 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh17Q9R100 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh17Q9R100 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh17Q9R100 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh17Q9R100 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh17Q9R100 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh17Q9R100 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh17Q9R100 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh17Q9R100 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh17Q9R100 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh17Q9R100 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh17Q9R100 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh17Q9R100 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh17Q9R100 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh17Q9R100 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh17Q9R100 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh17Q9R100 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh17Q9R100 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh17Q9R100 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh17Q9R100 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh17Q9R100 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh17Q9R100 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdh17Q9R100 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh17Q9R100 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh17Q9R100 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh17Q9R100 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh17Q9R100 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh17Q9R100 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh17Q9R100 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh17Q9R100 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh17Q9R100 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh17Q9R100 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh17Q9R100 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh17Q9R100 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh17Q9R100 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh17Q9R100 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh17Q9R100 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh17Q9R100 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh17Q9R100 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh17Q9R100 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh17Q9R100 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh17Q9R100 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh17Q9R100 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh17Q9R100 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh17Q9R100 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh17Q9R100 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh17Q9R100 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh17Q9R100 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh17Q9R100 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh17Q9R100 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cdh17Q9R100 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh17Q9R100 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh17Q9R100 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh17Q9R100 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh17Q9R100 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh17Q9R100 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh17Q9R100 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh17Q9R100 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh17Q9R100 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh17Q9R100 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh17Q9R100 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh17Q9R100 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh17Q9R100 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh17Q9R100 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh17Q9R100 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh17Q9R100 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh17Q9R100 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh17Q9R100 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.5 ms