Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SrpxQ9R0M3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrpxQ9R0M3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrpxQ9R0M3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrpxQ9R0M3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrpxQ9R0M3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrpxQ9R0M3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrpxQ9R0M3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrpxQ9R0M3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrpxQ9R0M3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SrpxQ9R0M3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SrpxQ9R0M3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SrpxQ9R0M3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrpxQ9R0M3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrpxQ9R0M3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrpxQ9R0M3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrpxQ9R0M3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrpxQ9R0M3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrpxQ9R0M3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrpxQ9R0M3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrpxQ9R0M3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrpxQ9R0M3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrpxQ9R0M3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrpxQ9R0M3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrpxQ9R0M3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrpxQ9R0M3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrpxQ9R0M3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrpxQ9R0M3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrpxQ9R0M3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrpxQ9R0M3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrpxQ9R0M3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrpxQ9R0M3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrpxQ9R0M3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrpxQ9R0M3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrpxQ9R0M3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrpxQ9R0M3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrpxQ9R0M3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrpxQ9R0M3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SrpxQ9R0M3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SrpxQ9R0M3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrpxQ9R0M3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrpxQ9R0M3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrpxQ9R0M3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrpxQ9R0M3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SrpxQ9R0M3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrpxQ9R0M3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrpxQ9R0M3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrpxQ9R0M3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrpxQ9R0M3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrpxQ9R0M3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrpxQ9R0M3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrpxQ9R0M3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrpxQ9R0M3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrpxQ9R0M3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrpxQ9R0M3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrpxQ9R0M3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrpxQ9R0M3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrpxQ9R0M3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrpxQ9R0M3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrpxQ9R0M3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrpxQ9R0M3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrpxQ9R0M3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrpxQ9R0M3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SrpxQ9R0M3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrpxQ9R0M3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrpxQ9R0M3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrpxQ9R0M3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrpxQ9R0M3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrpxQ9R0M3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrpxQ9R0M3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SrpxQ9R0M3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrpxQ9R0M3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrpxQ9R0M3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrpxQ9R0M3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrpxQ9R0M3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrpxQ9R0M3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrpxQ9R0M3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrpxQ9R0M3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrpxQ9R0M3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrpxQ9R0M3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrpxQ9R0M3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SrpxQ9R0M3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrpxQ9R0M3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrpxQ9R0M3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrpxQ9R0M3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrpxQ9R0M3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrpxQ9R0M3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrpxQ9R0M3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrpxQ9R0M3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrpxQ9R0M3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrpxQ9R0M3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrpxQ9R0M3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrpxQ9R0M3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrpxQ9R0M3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrpxQ9R0M3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SrpxQ9R0M3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrpxQ9R0M3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrpxQ9R0M3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrpxQ9R0M3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrpxQ9R0M3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms