Protein–RNA interactions for Protein: Q9R069

Bcam, Basal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcamQ9R069 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BcamQ9R069 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BcamQ9R069 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BcamQ9R069 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BcamQ9R069 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BcamQ9R069 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BcamQ9R069 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BcamQ9R069 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BcamQ9R069 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BcamQ9R069 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BcamQ9R069 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BcamQ9R069 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BcamQ9R069 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BcamQ9R069 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BcamQ9R069 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BcamQ9R069 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BcamQ9R069 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BcamQ9R069 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BcamQ9R069 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BcamQ9R069 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BcamQ9R069 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
BcamQ9R069 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BcamQ9R069 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BcamQ9R069 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BcamQ9R069 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BcamQ9R069 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
BcamQ9R069 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
BcamQ9R069 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BcamQ9R069 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BcamQ9R069 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BcamQ9R069 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BcamQ9R069 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BcamQ9R069 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BcamQ9R069 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BcamQ9R069 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BcamQ9R069 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BcamQ9R069 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
BcamQ9R069 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BcamQ9R069 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BcamQ9R069 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BcamQ9R069 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BcamQ9R069 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BcamQ9R069 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BcamQ9R069 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BcamQ9R069 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
BcamQ9R069 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BcamQ9R069 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BcamQ9R069 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BcamQ9R069 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BcamQ9R069 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BcamQ9R069 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BcamQ9R069 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BcamQ9R069 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BcamQ9R069 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BcamQ9R069 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BcamQ9R069 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BcamQ9R069 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BcamQ9R069 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
BcamQ9R069 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BcamQ9R069 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BcamQ9R069 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BcamQ9R069 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BcamQ9R069 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
BcamQ9R069 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BcamQ9R069 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BcamQ9R069 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BcamQ9R069 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BcamQ9R069 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BcamQ9R069 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BcamQ9R069 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BcamQ9R069 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BcamQ9R069 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BcamQ9R069 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BcamQ9R069 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BcamQ9R069 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BcamQ9R069 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BcamQ9R069 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BcamQ9R069 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BcamQ9R069 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BcamQ9R069 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BcamQ9R069 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BcamQ9R069 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BcamQ9R069 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BcamQ9R069 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BcamQ9R069 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BcamQ9R069 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BcamQ9R069 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BcamQ9R069 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BcamQ9R069 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BcamQ9R069 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BcamQ9R069 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BcamQ9R069 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BcamQ9R069 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BcamQ9R069 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
BcamQ9R069 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BcamQ9R069 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BcamQ9R069 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BcamQ9R069 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BcamQ9R069 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BcamQ9R069 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 404.1 ms