Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp11cQ9QZW0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp11cQ9QZW0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp11cQ9QZW0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp11cQ9QZW0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp11cQ9QZW0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp11cQ9QZW0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp11cQ9QZW0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp11cQ9QZW0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp11cQ9QZW0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp11cQ9QZW0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp11cQ9QZW0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp11cQ9QZW0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp11cQ9QZW0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp11cQ9QZW0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp11cQ9QZW0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp11cQ9QZW0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp11cQ9QZW0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp11cQ9QZW0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp11cQ9QZW0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp11cQ9QZW0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp11cQ9QZW0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp11cQ9QZW0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp11cQ9QZW0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp11cQ9QZW0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp11cQ9QZW0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp11cQ9QZW0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp11cQ9QZW0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp11cQ9QZW0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp11cQ9QZW0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp11cQ9QZW0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp11cQ9QZW0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp11cQ9QZW0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp11cQ9QZW0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp11cQ9QZW0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp11cQ9QZW0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp11cQ9QZW0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp11cQ9QZW0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp11cQ9QZW0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp11cQ9QZW0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp11cQ9QZW0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp11cQ9QZW0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp11cQ9QZW0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp11cQ9QZW0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp11cQ9QZW0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp11cQ9QZW0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp11cQ9QZW0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp11cQ9QZW0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp11cQ9QZW0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp11cQ9QZW0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp11cQ9QZW0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp11cQ9QZW0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp11cQ9QZW0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp11cQ9QZW0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp11cQ9QZW0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp11cQ9QZW0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp11cQ9QZW0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp11cQ9QZW0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp11cQ9QZW0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp11cQ9QZW0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp11cQ9QZW0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp11cQ9QZW0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp11cQ9QZW0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp11cQ9QZW0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp11cQ9QZW0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp11cQ9QZW0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp11cQ9QZW0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atp11cQ9QZW0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp11cQ9QZW0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp11cQ9QZW0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp11cQ9QZW0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp11cQ9QZW0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp11cQ9QZW0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp11cQ9QZW0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp11cQ9QZW0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp11cQ9QZW0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp11cQ9QZW0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp11cQ9QZW0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp11cQ9QZW0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp11cQ9QZW0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp11cQ9QZW0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp11cQ9QZW0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp11cQ9QZW0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp11cQ9QZW0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp11cQ9QZW0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp11cQ9QZW0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp11cQ9QZW0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp11cQ9QZW0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp11cQ9QZW0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp11cQ9QZW0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp11cQ9QZW0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp11cQ9QZW0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp11cQ9QZW0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp11cQ9QZW0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp11cQ9QZW0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp11cQ9QZW0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp11cQ9QZW0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp11cQ9QZW0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp11cQ9QZW0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp11cQ9QZW0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms