Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR0

Rnf25, E3 ubiquitin-protein ligase RNF25, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf25Q9QZR0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rnf25Q9QZR0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rnf25Q9QZR0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rnf25Q9QZR0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf25Q9QZR0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf25Q9QZR0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf25Q9QZR0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf25Q9QZR0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf25Q9QZR0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf25Q9QZR0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf25Q9QZR0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf25Q9QZR0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf25Q9QZR0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf25Q9QZR0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf25Q9QZR0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf25Q9QZR0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf25Q9QZR0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf25Q9QZR0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf25Q9QZR0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf25Q9QZR0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf25Q9QZR0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf25Q9QZR0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf25Q9QZR0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf25Q9QZR0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf25Q9QZR0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf25Q9QZR0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf25Q9QZR0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf25Q9QZR0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf25Q9QZR0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf25Q9QZR0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf25Q9QZR0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf25Q9QZR0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf25Q9QZR0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf25Q9QZR0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf25Q9QZR0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf25Q9QZR0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf25Q9QZR0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf25Q9QZR0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf25Q9QZR0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf25Q9QZR0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf25Q9QZR0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf25Q9QZR0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf25Q9QZR0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf25Q9QZR0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf25Q9QZR0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf25Q9QZR0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf25Q9QZR0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf25Q9QZR0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf25Q9QZR0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf25Q9QZR0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf25Q9QZR0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf25Q9QZR0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf25Q9QZR0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf25Q9QZR0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf25Q9QZR0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf25Q9QZR0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf25Q9QZR0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf25Q9QZR0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rnf25Q9QZR0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf25Q9QZR0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf25Q9QZR0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf25Q9QZR0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf25Q9QZR0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf25Q9QZR0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf25Q9QZR0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf25Q9QZR0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf25Q9QZR0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf25Q9QZR0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf25Q9QZR0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf25Q9QZR0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf25Q9QZR0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf25Q9QZR0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf25Q9QZR0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf25Q9QZR0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf25Q9QZR0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf25Q9QZR0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf25Q9QZR0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf25Q9QZR0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf25Q9QZR0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf25Q9QZR0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf25Q9QZR0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf25Q9QZR0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf25Q9QZR0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf25Q9QZR0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf25Q9QZR0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf25Q9QZR0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf25Q9QZR0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rnf25Q9QZR0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Rnf25Q9QZR0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf25Q9QZR0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf25Q9QZR0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf25Q9QZR0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf25Q9QZR0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf25Q9QZR0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf25Q9QZR0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf25Q9QZR0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf25Q9QZR0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf25Q9QZR0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf25Q9QZR0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf25Q9QZR0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms