Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndrg3Q9QYF9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndrg3Q9QYF9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndrg3Q9QYF9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndrg3Q9QYF9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndrg3Q9QYF9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndrg3Q9QYF9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndrg3Q9QYF9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndrg3Q9QYF9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndrg3Q9QYF9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndrg3Q9QYF9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndrg3Q9QYF9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndrg3Q9QYF9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndrg3Q9QYF9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndrg3Q9QYF9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndrg3Q9QYF9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndrg3Q9QYF9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndrg3Q9QYF9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndrg3Q9QYF9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndrg3Q9QYF9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndrg3Q9QYF9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndrg3Q9QYF9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndrg3Q9QYF9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndrg3Q9QYF9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndrg3Q9QYF9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ndrg3Q9QYF9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ndrg3Q9QYF9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ndrg3Q9QYF9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndrg3Q9QYF9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndrg3Q9QYF9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndrg3Q9QYF9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndrg3Q9QYF9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndrg3Q9QYF9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndrg3Q9QYF9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ndrg3Q9QYF9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ndrg3Q9QYF9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ndrg3Q9QYF9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ndrg3Q9QYF9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ndrg3Q9QYF9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ndrg3Q9QYF9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ndrg3Q9QYF9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ndrg3Q9QYF9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ndrg3Q9QYF9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ndrg3Q9QYF9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ndrg3Q9QYF9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ndrg3Q9QYF9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ndrg3Q9QYF9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ndrg3Q9QYF9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ndrg3Q9QYF9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ndrg3Q9QYF9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ndrg3Q9QYF9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ndrg3Q9QYF9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ndrg3Q9QYF9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ndrg3Q9QYF9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ndrg3Q9QYF9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ndrg3Q9QYF9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ndrg3Q9QYF9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ndrg3Q9QYF9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ndrg3Q9QYF9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ndrg3Q9QYF9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ndrg3Q9QYF9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ndrg3Q9QYF9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ndrg3Q9QYF9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ndrg3Q9QYF9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ndrg3Q9QYF9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ndrg3Q9QYF9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ndrg3Q9QYF9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ndrg3Q9QYF9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ndrg3Q9QYF9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ndrg3Q9QYF9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ndrg3Q9QYF9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ndrg3Q9QYF9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ndrg3Q9QYF9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ndrg3Q9QYF9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ndrg3Q9QYF9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ndrg3Q9QYF9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ndrg3Q9QYF9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ndrg3Q9QYF9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ndrg3Q9QYF9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ndrg3Q9QYF9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ndrg3Q9QYF9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ndrg3Q9QYF9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ndrg3Q9QYF9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ndrg3Q9QYF9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ndrg3Q9QYF9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ndrg3Q9QYF9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ndrg3Q9QYF9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ndrg3Q9QYF9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ndrg3Q9QYF9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ndrg3Q9QYF9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ndrg3Q9QYF9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ndrg3Q9QYF9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ndrg3Q9QYF9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ndrg3Q9QYF9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ndrg3Q9QYF9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ndrg3Q9QYF9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ndrg3Q9QYF9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ndrg3Q9QYF9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ndrg3Q9QYF9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ndrg3Q9QYF9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms