Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWT9

Kifc1, Kinesin-like protein KIFC1, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kifc1Q9QWT9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kifc1Q9QWT9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kifc1Q9QWT9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kifc1Q9QWT9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kifc1Q9QWT9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kifc1Q9QWT9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kifc1Q9QWT9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kifc1Q9QWT9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kifc1Q9QWT9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Kifc1Q9QWT9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kifc1Q9QWT9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kifc1Q9QWT9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kifc1Q9QWT9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kifc1Q9QWT9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kifc1Q9QWT9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kifc1Q9QWT9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kifc1Q9QWT9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kifc1Q9QWT9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kifc1Q9QWT9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kifc1Q9QWT9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kifc1Q9QWT9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kifc1Q9QWT9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kifc1Q9QWT9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kifc1Q9QWT9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kifc1Q9QWT9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kifc1Q9QWT9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kifc1Q9QWT9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kifc1Q9QWT9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kifc1Q9QWT9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kifc1Q9QWT9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kifc1Q9QWT9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Kifc1Q9QWT9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kifc1Q9QWT9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kifc1Q9QWT9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kifc1Q9QWT9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kifc1Q9QWT9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kifc1Q9QWT9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kifc1Q9QWT9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kifc1Q9QWT9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kifc1Q9QWT9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kifc1Q9QWT9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kifc1Q9QWT9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kifc1Q9QWT9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kifc1Q9QWT9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kifc1Q9QWT9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kifc1Q9QWT9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Kifc1Q9QWT9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kifc1Q9QWT9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kifc1Q9QWT9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kifc1Q9QWT9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kifc1Q9QWT9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kifc1Q9QWT9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kifc1Q9QWT9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Kifc1Q9QWT9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kifc1Q9QWT9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kifc1Q9QWT9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kifc1Q9QWT9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kifc1Q9QWT9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kifc1Q9QWT9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kifc1Q9QWT9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kifc1Q9QWT9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kifc1Q9QWT9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kifc1Q9QWT9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kifc1Q9QWT9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kifc1Q9QWT9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kifc1Q9QWT9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Kifc1Q9QWT9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kifc1Q9QWT9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kifc1Q9QWT9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kifc1Q9QWT9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kifc1Q9QWT9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Kifc1Q9QWT9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kifc1Q9QWT9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kifc1Q9QWT9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kifc1Q9QWT9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kifc1Q9QWT9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kifc1Q9QWT9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kifc1Q9QWT9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kifc1Q9QWT9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kifc1Q9QWT9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kifc1Q9QWT9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kifc1Q9QWT9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Kifc1Q9QWT9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kifc1Q9QWT9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kifc1Q9QWT9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kifc1Q9QWT9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kifc1Q9QWT9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kifc1Q9QWT9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kifc1Q9QWT9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kifc1Q9QWT9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kifc1Q9QWT9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kifc1Q9QWT9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kifc1Q9QWT9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kifc1Q9QWT9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kifc1Q9QWT9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kifc1Q9QWT9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kifc1Q9QWT9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kifc1Q9QWT9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kifc1Q9QWT9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Kifc1Q9QWT9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms