Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PdcQ9QW08 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PdcQ9QW08 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PdcQ9QW08 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PdcQ9QW08 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PdcQ9QW08 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PdcQ9QW08 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PdcQ9QW08 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PdcQ9QW08 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PdcQ9QW08 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PdcQ9QW08 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PdcQ9QW08 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PdcQ9QW08 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PdcQ9QW08 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PdcQ9QW08 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PdcQ9QW08 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PdcQ9QW08 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PdcQ9QW08 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PdcQ9QW08 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PdcQ9QW08 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PdcQ9QW08 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PdcQ9QW08 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PdcQ9QW08 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PdcQ9QW08 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PdcQ9QW08 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PdcQ9QW08 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PdcQ9QW08 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PdcQ9QW08 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PdcQ9QW08 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PdcQ9QW08 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PdcQ9QW08 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PdcQ9QW08 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PdcQ9QW08 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PdcQ9QW08 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PdcQ9QW08 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PdcQ9QW08 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PdcQ9QW08 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PdcQ9QW08 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PdcQ9QW08 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PdcQ9QW08 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PdcQ9QW08 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PdcQ9QW08 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PdcQ9QW08 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PdcQ9QW08 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PdcQ9QW08 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PdcQ9QW08 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PdcQ9QW08 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PdcQ9QW08 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PdcQ9QW08 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PdcQ9QW08 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PdcQ9QW08 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PdcQ9QW08 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PdcQ9QW08 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PdcQ9QW08 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PdcQ9QW08 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PdcQ9QW08 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PdcQ9QW08 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PdcQ9QW08 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PdcQ9QW08 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PdcQ9QW08 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PdcQ9QW08 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PdcQ9QW08 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PdcQ9QW08 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PdcQ9QW08 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PdcQ9QW08 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PdcQ9QW08 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PdcQ9QW08 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PdcQ9QW08 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PdcQ9QW08 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PdcQ9QW08 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PdcQ9QW08 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PdcQ9QW08 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PdcQ9QW08 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PdcQ9QW08 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PdcQ9QW08 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PdcQ9QW08 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PdcQ9QW08 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PdcQ9QW08 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PdcQ9QW08 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PdcQ9QW08 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PdcQ9QW08 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PdcQ9QW08 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PdcQ9QW08 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PdcQ9QW08 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PdcQ9QW08 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PdcQ9QW08 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PdcQ9QW08 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PdcQ9QW08 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PdcQ9QW08 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PdcQ9QW08 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PdcQ9QW08 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PdcQ9QW08 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PdcQ9QW08 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PdcQ9QW08 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PdcQ9QW08 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PdcQ9QW08 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PdcQ9QW08 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PdcQ9QW08 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PdcQ9QW08 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PdcQ9QW08 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms