Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUR6

Prep, Prolyl endopeptidase, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrepQ9QUR6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrepQ9QUR6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrepQ9QUR6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrepQ9QUR6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PrepQ9QUR6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrepQ9QUR6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PrepQ9QUR6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrepQ9QUR6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrepQ9QUR6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrepQ9QUR6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PrepQ9QUR6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrepQ9QUR6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrepQ9QUR6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrepQ9QUR6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrepQ9QUR6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrepQ9QUR6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PrepQ9QUR6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrepQ9QUR6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrepQ9QUR6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PrepQ9QUR6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrepQ9QUR6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrepQ9QUR6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrepQ9QUR6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrepQ9QUR6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PrepQ9QUR6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PrepQ9QUR6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PrepQ9QUR6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrepQ9QUR6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrepQ9QUR6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PrepQ9QUR6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrepQ9QUR6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrepQ9QUR6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrepQ9QUR6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrepQ9QUR6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrepQ9QUR6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrepQ9QUR6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrepQ9QUR6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrepQ9QUR6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrepQ9QUR6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrepQ9QUR6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrepQ9QUR6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrepQ9QUR6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrepQ9QUR6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrepQ9QUR6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrepQ9QUR6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrepQ9QUR6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrepQ9QUR6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrepQ9QUR6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrepQ9QUR6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrepQ9QUR6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrepQ9QUR6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrepQ9QUR6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrepQ9QUR6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PrepQ9QUR6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrepQ9QUR6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrepQ9QUR6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrepQ9QUR6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrepQ9QUR6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrepQ9QUR6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PrepQ9QUR6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrepQ9QUR6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrepQ9QUR6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrepQ9QUR6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrepQ9QUR6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrepQ9QUR6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrepQ9QUR6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrepQ9QUR6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrepQ9QUR6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrepQ9QUR6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrepQ9QUR6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrepQ9QUR6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrepQ9QUR6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrepQ9QUR6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrepQ9QUR6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrepQ9QUR6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PrepQ9QUR6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrepQ9QUR6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrepQ9QUR6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrepQ9QUR6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PrepQ9QUR6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PrepQ9QUR6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrepQ9QUR6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrepQ9QUR6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PrepQ9QUR6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrepQ9QUR6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrepQ9QUR6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrepQ9QUR6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrepQ9QUR6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrepQ9QUR6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrepQ9QUR6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrepQ9QUR6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrepQ9QUR6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrepQ9QUR6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrepQ9QUR6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrepQ9QUR6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrepQ9QUR6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrepQ9QUR6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrepQ9QUR6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrepQ9QUR6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrepQ9QUR6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms