Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG4

Nkain4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain4Q9JMG4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nkain4Q9JMG4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nkain4Q9JMG4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nkain4Q9JMG4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nkain4Q9JMG4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nkain4Q9JMG4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nkain4Q9JMG4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nkain4Q9JMG4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nkain4Q9JMG4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nkain4Q9JMG4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nkain4Q9JMG4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nkain4Q9JMG4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nkain4Q9JMG4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nkain4Q9JMG4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nkain4Q9JMG4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nkain4Q9JMG4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nkain4Q9JMG4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nkain4Q9JMG4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nkain4Q9JMG4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nkain4Q9JMG4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nkain4Q9JMG4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nkain4Q9JMG4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nkain4Q9JMG4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nkain4Q9JMG4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nkain4Q9JMG4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nkain4Q9JMG4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nkain4Q9JMG4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nkain4Q9JMG4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nkain4Q9JMG4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nkain4Q9JMG4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nkain4Q9JMG4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nkain4Q9JMG4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nkain4Q9JMG4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nkain4Q9JMG4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nkain4Q9JMG4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nkain4Q9JMG4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nkain4Q9JMG4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nkain4Q9JMG4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nkain4Q9JMG4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nkain4Q9JMG4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nkain4Q9JMG4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nkain4Q9JMG4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nkain4Q9JMG4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkain4Q9JMG4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkain4Q9JMG4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkain4Q9JMG4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nkain4Q9JMG4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nkain4Q9JMG4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nkain4Q9JMG4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nkain4Q9JMG4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nkain4Q9JMG4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Nkain4Q9JMG4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nkain4Q9JMG4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nkain4Q9JMG4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nkain4Q9JMG4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nkain4Q9JMG4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nkain4Q9JMG4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nkain4Q9JMG4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nkain4Q9JMG4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkain4Q9JMG4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkain4Q9JMG4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkain4Q9JMG4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkain4Q9JMG4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkain4Q9JMG4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkain4Q9JMG4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkain4Q9JMG4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkain4Q9JMG4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkain4Q9JMG4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkain4Q9JMG4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkain4Q9JMG4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkain4Q9JMG4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkain4Q9JMG4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkain4Q9JMG4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nkain4Q9JMG4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nkain4Q9JMG4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nkain4Q9JMG4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nkain4Q9JMG4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkain4Q9JMG4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkain4Q9JMG4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkain4Q9JMG4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkain4Q9JMG4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkain4Q9JMG4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkain4Q9JMG4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkain4Q9JMG4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkain4Q9JMG4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkain4Q9JMG4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkain4Q9JMG4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkain4Q9JMG4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkain4Q9JMG4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkain4Q9JMG4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkain4Q9JMG4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkain4Q9JMG4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkain4Q9JMG4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkain4Q9JMG4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkain4Q9JMG4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkain4Q9JMG4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkain4Q9JMG4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkain4Q9JMG4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkain4Q9JMG4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkain4Q9JMG4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms