Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ap3b2Q9JME5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ap3b2Q9JME5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ap3b2Q9JME5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Ap3b2Q9JME5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ap3b2Q9JME5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ap3b2Q9JME5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Ap3b2Q9JME5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ap3b2Q9JME5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ap3b2Q9JME5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Ap3b2Q9JME5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ap3b2Q9JME5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ap3b2Q9JME5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Ap3b2Q9JME5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ap3b2Q9JME5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Ap3b2Q9JME5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ap3b2Q9JME5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ap3b2Q9JME5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Ap3b2Q9JME5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ap3b2Q9JME5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ap3b2Q9JME5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ap3b2Q9JME5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ap3b2Q9JME5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ap3b2Q9JME5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ap3b2Q9JME5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ap3b2Q9JME5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ap3b2Q9JME5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ap3b2Q9JME5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ap3b2Q9JME5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ap3b2Q9JME5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ap3b2Q9JME5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ap3b2Q9JME5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ap3b2Q9JME5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ap3b2Q9JME5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ap3b2Q9JME5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ap3b2Q9JME5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ap3b2Q9JME5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Ap3b2Q9JME5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ap3b2Q9JME5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ap3b2Q9JME5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ap3b2Q9JME5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ap3b2Q9JME5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Ap3b2Q9JME5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ap3b2Q9JME5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ap3b2Q9JME5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Ap3b2Q9JME5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ap3b2Q9JME5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ap3b2Q9JME5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ap3b2Q9JME5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ap3b2Q9JME5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ap3b2Q9JME5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ap3b2Q9JME5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ap3b2Q9JME5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ap3b2Q9JME5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ap3b2Q9JME5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ap3b2Q9JME5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ap3b2Q9JME5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ap3b2Q9JME5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ap3b2Q9JME5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Ap3b2Q9JME5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Ap3b2Q9JME5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ap3b2Q9JME5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ap3b2Q9JME5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ap3b2Q9JME5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ap3b2Q9JME5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Ap3b2Q9JME5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ap3b2Q9JME5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ap3b2Q9JME5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ap3b2Q9JME5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ap3b2Q9JME5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ap3b2Q9JME5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ap3b2Q9JME5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ap3b2Q9JME5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ap3b2Q9JME5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ap3b2Q9JME5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ap3b2Q9JME5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ap3b2Q9JME5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ap3b2Q9JME5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ap3b2Q9JME5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ap3b2Q9JME5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Ap3b2Q9JME5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ap3b2Q9JME5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ap3b2Q9JME5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ap3b2Q9JME5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ap3b2Q9JME5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
Ap3b2Q9JME5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ap3b2Q9JME5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ap3b2Q9JME5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ap3b2Q9JME5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ap3b2Q9JME5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ap3b2Q9JME5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ap3b2Q9JME5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ap3b2Q9JME5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ap3b2Q9JME5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ap3b2Q9JME5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Ap3b2Q9JME5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ap3b2Q9JME5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ap3b2Q9JME5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ap3b2Q9JME5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ap3b2Q9JME5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms