Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rfx5Q9JL61 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rfx5Q9JL61 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rfx5Q9JL61 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rfx5Q9JL61 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rfx5Q9JL61 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rfx5Q9JL61 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rfx5Q9JL61 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rfx5Q9JL61 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rfx5Q9JL61 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rfx5Q9JL61 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rfx5Q9JL61 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rfx5Q9JL61 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rfx5Q9JL61 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rfx5Q9JL61 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rfx5Q9JL61 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rfx5Q9JL61 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rfx5Q9JL61 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rfx5Q9JL61 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rfx5Q9JL61 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rfx5Q9JL61 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rfx5Q9JL61 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rfx5Q9JL61 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rfx5Q9JL61 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rfx5Q9JL61 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rfx5Q9JL61 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rfx5Q9JL61 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rfx5Q9JL61 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rfx5Q9JL61 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rfx5Q9JL61 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rfx5Q9JL61 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rfx5Q9JL61 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rfx5Q9JL61 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rfx5Q9JL61 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rfx5Q9JL61 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rfx5Q9JL61 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rfx5Q9JL61 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rfx5Q9JL61 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rfx5Q9JL61 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rfx5Q9JL61 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rfx5Q9JL61 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rfx5Q9JL61 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rfx5Q9JL61 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rfx5Q9JL61 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rfx5Q9JL61 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rfx5Q9JL61 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rfx5Q9JL61 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rfx5Q9JL61 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rfx5Q9JL61 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rfx5Q9JL61 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rfx5Q9JL61 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rfx5Q9JL61 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rfx5Q9JL61 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rfx5Q9JL61 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rfx5Q9JL61 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rfx5Q9JL61 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rfx5Q9JL61 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rfx5Q9JL61 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rfx5Q9JL61 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rfx5Q9JL61 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rfx5Q9JL61 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rfx5Q9JL61 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rfx5Q9JL61 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rfx5Q9JL61 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rfx5Q9JL61 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rfx5Q9JL61 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rfx5Q9JL61 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rfx5Q9JL61 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rfx5Q9JL61 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rfx5Q9JL61 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rfx5Q9JL61 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rfx5Q9JL61 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx5Q9JL61 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx5Q9JL61 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx5Q9JL61 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx5Q9JL61 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx5Q9JL61 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx5Q9JL61 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rfx5Q9JL61 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfx5Q9JL61 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfx5Q9JL61 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfx5Q9JL61 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rfx5Q9JL61 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rfx5Q9JL61 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rfx5Q9JL61 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rfx5Q9JL61 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rfx5Q9JL61 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rfx5Q9JL61 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rfx5Q9JL61 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rfx5Q9JL61 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rfx5Q9JL61 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rfx5Q9JL61 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rfx5Q9JL61 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rfx5Q9JL61 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rfx5Q9JL61 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rfx5Q9JL61 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rfx5Q9JL61 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rfx5Q9JL61 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rfx5Q9JL61 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rfx5Q9JL61 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms