Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmx1aQ9JKU8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmx1aQ9JKU8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmx1aQ9JKU8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmx1aQ9JKU8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmx1aQ9JKU8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmx1aQ9JKU8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmx1aQ9JKU8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmx1aQ9JKU8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmx1aQ9JKU8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmx1aQ9JKU8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmx1aQ9JKU8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmx1aQ9JKU8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmx1aQ9JKU8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmx1aQ9JKU8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmx1aQ9JKU8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmx1aQ9JKU8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmx1aQ9JKU8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmx1aQ9JKU8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmx1aQ9JKU8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmx1aQ9JKU8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmx1aQ9JKU8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmx1aQ9JKU8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmx1aQ9JKU8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmx1aQ9JKU8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmx1aQ9JKU8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmx1aQ9JKU8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmx1aQ9JKU8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmx1aQ9JKU8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmx1aQ9JKU8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmx1aQ9JKU8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmx1aQ9JKU8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmx1aQ9JKU8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmx1aQ9JKU8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmx1aQ9JKU8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmx1aQ9JKU8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmx1aQ9JKU8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmx1aQ9JKU8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmx1aQ9JKU8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmx1aQ9JKU8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmx1aQ9JKU8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmx1aQ9JKU8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmx1aQ9JKU8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmx1aQ9JKU8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmx1aQ9JKU8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmx1aQ9JKU8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmx1aQ9JKU8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmx1aQ9JKU8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmx1aQ9JKU8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmx1aQ9JKU8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmx1aQ9JKU8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmx1aQ9JKU8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmx1aQ9JKU8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmx1aQ9JKU8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmx1aQ9JKU8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmx1aQ9JKU8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmx1aQ9JKU8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmx1aQ9JKU8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmx1aQ9JKU8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmx1aQ9JKU8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmx1aQ9JKU8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmx1aQ9JKU8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmx1aQ9JKU8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmx1aQ9JKU8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmx1aQ9JKU8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmx1aQ9JKU8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmx1aQ9JKU8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmx1aQ9JKU8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmx1aQ9JKU8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmx1aQ9JKU8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmx1aQ9JKU8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmx1aQ9JKU8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmx1aQ9JKU8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmx1aQ9JKU8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmx1aQ9JKU8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmx1aQ9JKU8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmx1aQ9JKU8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmx1aQ9JKU8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmx1aQ9JKU8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lmx1aQ9JKU8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lmx1aQ9JKU8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmx1aQ9JKU8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmx1aQ9JKU8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmx1aQ9JKU8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmx1aQ9JKU8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmx1aQ9JKU8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmx1aQ9JKU8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmx1aQ9JKU8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmx1aQ9JKU8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmx1aQ9JKU8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmx1aQ9JKU8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmx1aQ9JKU8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmx1aQ9JKU8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmx1aQ9JKU8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmx1aQ9JKU8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmx1aQ9JKU8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmx1aQ9JKU8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmx1aQ9JKU8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmx1aQ9JKU8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmx1aQ9JKU8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms