Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tuba8Q9JJZ2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tuba8Q9JJZ2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tuba8Q9JJZ2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tuba8Q9JJZ2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tuba8Q9JJZ2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tuba8Q9JJZ2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tuba8Q9JJZ2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tuba8Q9JJZ2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tuba8Q9JJZ2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tuba8Q9JJZ2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tuba8Q9JJZ2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tuba8Q9JJZ2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tuba8Q9JJZ2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tuba8Q9JJZ2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tuba8Q9JJZ2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tuba8Q9JJZ2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tuba8Q9JJZ2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tuba8Q9JJZ2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tuba8Q9JJZ2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tuba8Q9JJZ2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tuba8Q9JJZ2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tuba8Q9JJZ2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tuba8Q9JJZ2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tuba8Q9JJZ2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tuba8Q9JJZ2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tuba8Q9JJZ2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tuba8Q9JJZ2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tuba8Q9JJZ2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tuba8Q9JJZ2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tuba8Q9JJZ2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tuba8Q9JJZ2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tuba8Q9JJZ2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tuba8Q9JJZ2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tuba8Q9JJZ2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tuba8Q9JJZ2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tuba8Q9JJZ2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tuba8Q9JJZ2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tuba8Q9JJZ2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tuba8Q9JJZ2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tuba8Q9JJZ2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tuba8Q9JJZ2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tuba8Q9JJZ2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tuba8Q9JJZ2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tuba8Q9JJZ2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tuba8Q9JJZ2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tuba8Q9JJZ2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tuba8Q9JJZ2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tuba8Q9JJZ2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tuba8Q9JJZ2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tuba8Q9JJZ2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tuba8Q9JJZ2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tuba8Q9JJZ2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tuba8Q9JJZ2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tuba8Q9JJZ2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tuba8Q9JJZ2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tuba8Q9JJZ2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tuba8Q9JJZ2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tuba8Q9JJZ2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tuba8Q9JJZ2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tuba8Q9JJZ2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tuba8Q9JJZ2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tuba8Q9JJZ2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tuba8Q9JJZ2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tuba8Q9JJZ2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tuba8Q9JJZ2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tuba8Q9JJZ2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tuba8Q9JJZ2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tuba8Q9JJZ2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tuba8Q9JJZ2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tuba8Q9JJZ2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tuba8Q9JJZ2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tuba8Q9JJZ2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tuba8Q9JJZ2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tuba8Q9JJZ2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tuba8Q9JJZ2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tuba8Q9JJZ2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tuba8Q9JJZ2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tuba8Q9JJZ2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tuba8Q9JJZ2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tuba8Q9JJZ2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tuba8Q9JJZ2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tuba8Q9JJZ2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tuba8Q9JJZ2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tuba8Q9JJZ2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tuba8Q9JJZ2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tuba8Q9JJZ2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tuba8Q9JJZ2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tuba8Q9JJZ2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tuba8Q9JJZ2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tuba8Q9JJZ2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tuba8Q9JJZ2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tuba8Q9JJZ2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tuba8Q9JJZ2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tuba8Q9JJZ2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tuba8Q9JJZ2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tuba8Q9JJZ2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tuba8Q9JJZ2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tuba8Q9JJZ2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tuba8Q9JJZ2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms