Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Zfhx4Q9JJN2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zfhx4Q9JJN2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zfhx4Q9JJN2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zfhx4Q9JJN2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zfhx4Q9JJN2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zfhx4Q9JJN2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfhx4Q9JJN2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfhx4Q9JJN2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfhx4Q9JJN2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfhx4Q9JJN2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfhx4Q9JJN2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfhx4Q9JJN2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfhx4Q9JJN2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfhx4Q9JJN2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfhx4Q9JJN2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfhx4Q9JJN2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfhx4Q9JJN2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfhx4Q9JJN2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfhx4Q9JJN2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfhx4Q9JJN2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfhx4Q9JJN2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfhx4Q9JJN2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfhx4Q9JJN2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfhx4Q9JJN2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfhx4Q9JJN2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfhx4Q9JJN2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfhx4Q9JJN2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfhx4Q9JJN2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfhx4Q9JJN2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfhx4Q9JJN2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zfhx4Q9JJN2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zfhx4Q9JJN2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zfhx4Q9JJN2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zfhx4Q9JJN2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zfhx4Q9JJN2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfhx4Q9JJN2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfhx4Q9JJN2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfhx4Q9JJN2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfhx4Q9JJN2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfhx4Q9JJN2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfhx4Q9JJN2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfhx4Q9JJN2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfhx4Q9JJN2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfhx4Q9JJN2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfhx4Q9JJN2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfhx4Q9JJN2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfhx4Q9JJN2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfhx4Q9JJN2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfhx4Q9JJN2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfhx4Q9JJN2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfhx4Q9JJN2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfhx4Q9JJN2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfhx4Q9JJN2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfhx4Q9JJN2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfhx4Q9JJN2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfhx4Q9JJN2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfhx4Q9JJN2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfhx4Q9JJN2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfhx4Q9JJN2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfhx4Q9JJN2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfhx4Q9JJN2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfhx4Q9JJN2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfhx4Q9JJN2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Zfhx4Q9JJN2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Zfhx4Q9JJN2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Zfhx4Q9JJN2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfhx4Q9JJN2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfhx4Q9JJN2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfhx4Q9JJN2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfhx4Q9JJN2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfhx4Q9JJN2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfhx4Q9JJN2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfhx4Q9JJN2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfhx4Q9JJN2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfhx4Q9JJN2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfhx4Q9JJN2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfhx4Q9JJN2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfhx4Q9JJN2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfhx4Q9JJN2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfhx4Q9JJN2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfhx4Q9JJN2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfhx4Q9JJN2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfhx4Q9JJN2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfhx4Q9JJN2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfhx4Q9JJN2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfhx4Q9JJN2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfhx4Q9JJN2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfhx4Q9JJN2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfhx4Q9JJN2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfhx4Q9JJN2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfhx4Q9JJN2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfhx4Q9JJN2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfhx4Q9JJN2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfhx4Q9JJN2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfhx4Q9JJN2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfhx4Q9JJN2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfhx4Q9JJN2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfhx4Q9JJN2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfhx4Q9JJN2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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