Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smad9Q9JIW5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smad9Q9JIW5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smad9Q9JIW5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smad9Q9JIW5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smad9Q9JIW5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smad9Q9JIW5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smad9Q9JIW5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smad9Q9JIW5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smad9Q9JIW5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smad9Q9JIW5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smad9Q9JIW5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smad9Q9JIW5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smad9Q9JIW5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smad9Q9JIW5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smad9Q9JIW5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smad9Q9JIW5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smad9Q9JIW5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smad9Q9JIW5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smad9Q9JIW5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smad9Q9JIW5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smad9Q9JIW5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smad9Q9JIW5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smad9Q9JIW5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smad9Q9JIW5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smad9Q9JIW5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smad9Q9JIW5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smad9Q9JIW5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smad9Q9JIW5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smad9Q9JIW5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smad9Q9JIW5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smad9Q9JIW5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smad9Q9JIW5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smad9Q9JIW5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smad9Q9JIW5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smad9Q9JIW5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smad9Q9JIW5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smad9Q9JIW5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smad9Q9JIW5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smad9Q9JIW5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smad9Q9JIW5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smad9Q9JIW5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smad9Q9JIW5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smad9Q9JIW5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smad9Q9JIW5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smad9Q9JIW5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smad9Q9JIW5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smad9Q9JIW5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smad9Q9JIW5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smad9Q9JIW5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smad9Q9JIW5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smad9Q9JIW5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smad9Q9JIW5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smad9Q9JIW5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smad9Q9JIW5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smad9Q9JIW5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Smad9Q9JIW5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smad9Q9JIW5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smad9Q9JIW5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smad9Q9JIW5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smad9Q9JIW5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smad9Q9JIW5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smad9Q9JIW5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smad9Q9JIW5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smad9Q9JIW5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smad9Q9JIW5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smad9Q9JIW5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smad9Q9JIW5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smad9Q9JIW5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smad9Q9JIW5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smad9Q9JIW5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smad9Q9JIW5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smad9Q9JIW5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smad9Q9JIW5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smad9Q9JIW5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smad9Q9JIW5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smad9Q9JIW5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smad9Q9JIW5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smad9Q9JIW5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smad9Q9JIW5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smad9Q9JIW5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Smad9Q9JIW5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smad9Q9JIW5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smad9Q9JIW5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smad9Q9JIW5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smad9Q9JIW5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Smad9Q9JIW5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smad9Q9JIW5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smad9Q9JIW5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smad9Q9JIW5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smad9Q9JIW5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smad9Q9JIW5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smad9Q9JIW5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smad9Q9JIW5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smad9Q9JIW5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smad9Q9JIW5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smad9Q9JIW5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Smad9Q9JIW5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smad9Q9JIW5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smad9Q9JIW5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms