Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmod3Q9JHJ0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmod3Q9JHJ0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmod3Q9JHJ0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmod3Q9JHJ0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmod3Q9JHJ0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmod3Q9JHJ0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmod3Q9JHJ0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmod3Q9JHJ0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmod3Q9JHJ0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmod3Q9JHJ0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmod3Q9JHJ0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmod3Q9JHJ0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmod3Q9JHJ0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmod3Q9JHJ0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmod3Q9JHJ0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmod3Q9JHJ0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmod3Q9JHJ0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmod3Q9JHJ0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmod3Q9JHJ0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmod3Q9JHJ0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmod3Q9JHJ0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmod3Q9JHJ0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmod3Q9JHJ0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmod3Q9JHJ0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmod3Q9JHJ0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmod3Q9JHJ0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmod3Q9JHJ0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmod3Q9JHJ0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmod3Q9JHJ0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmod3Q9JHJ0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmod3Q9JHJ0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmod3Q9JHJ0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmod3Q9JHJ0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmod3Q9JHJ0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmod3Q9JHJ0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmod3Q9JHJ0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmod3Q9JHJ0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmod3Q9JHJ0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmod3Q9JHJ0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmod3Q9JHJ0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmod3Q9JHJ0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmod3Q9JHJ0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmod3Q9JHJ0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmod3Q9JHJ0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmod3Q9JHJ0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmod3Q9JHJ0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmod3Q9JHJ0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmod3Q9JHJ0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmod3Q9JHJ0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmod3Q9JHJ0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tmod3Q9JHJ0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tmod3Q9JHJ0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmod3Q9JHJ0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmod3Q9JHJ0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmod3Q9JHJ0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmod3Q9JHJ0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmod3Q9JHJ0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmod3Q9JHJ0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmod3Q9JHJ0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmod3Q9JHJ0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmod3Q9JHJ0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmod3Q9JHJ0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmod3Q9JHJ0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmod3Q9JHJ0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmod3Q9JHJ0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmod3Q9JHJ0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmod3Q9JHJ0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmod3Q9JHJ0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmod3Q9JHJ0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmod3Q9JHJ0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmod3Q9JHJ0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmod3Q9JHJ0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmod3Q9JHJ0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmod3Q9JHJ0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmod3Q9JHJ0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmod3Q9JHJ0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmod3Q9JHJ0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmod3Q9JHJ0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmod3Q9JHJ0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmod3Q9JHJ0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmod3Q9JHJ0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmod3Q9JHJ0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmod3Q9JHJ0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmod3Q9JHJ0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmod3Q9JHJ0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmod3Q9JHJ0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmod3Q9JHJ0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmod3Q9JHJ0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmod3Q9JHJ0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmod3Q9JHJ0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmod3Q9JHJ0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmod3Q9JHJ0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmod3Q9JHJ0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmod3Q9JHJ0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmod3Q9JHJ0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmod3Q9JHJ0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmod3Q9JHJ0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmod3Q9JHJ0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
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