Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn12Q9ET43 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn12Q9ET43 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn12Q9ET43 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn12Q9ET43 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cldn12Q9ET43 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn12Q9ET43 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn12Q9ET43 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn12Q9ET43 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn12Q9ET43 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn12Q9ET43 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn12Q9ET43 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn12Q9ET43 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn12Q9ET43 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn12Q9ET43 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn12Q9ET43 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn12Q9ET43 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn12Q9ET43 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn12Q9ET43 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn12Q9ET43 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn12Q9ET43 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn12Q9ET43 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn12Q9ET43 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn12Q9ET43 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn12Q9ET43 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn12Q9ET43 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn12Q9ET43 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn12Q9ET43 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn12Q9ET43 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn12Q9ET43 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn12Q9ET43 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn12Q9ET43 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn12Q9ET43 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn12Q9ET43 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn12Q9ET43 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn12Q9ET43 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn12Q9ET43 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn12Q9ET43 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn12Q9ET43 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cldn12Q9ET43 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cldn12Q9ET43 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cldn12Q9ET43 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cldn12Q9ET43 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cldn12Q9ET43 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn12Q9ET43 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn12Q9ET43 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn12Q9ET43 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn12Q9ET43 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn12Q9ET43 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn12Q9ET43 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn12Q9ET43 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn12Q9ET43 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn12Q9ET43 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn12Q9ET43 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn12Q9ET43 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn12Q9ET43 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn12Q9ET43 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn12Q9ET43 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn12Q9ET43 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn12Q9ET43 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn12Q9ET43 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn12Q9ET43 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn12Q9ET43 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn12Q9ET43 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn12Q9ET43 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn12Q9ET43 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn12Q9ET43 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn12Q9ET43 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn12Q9ET43 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn12Q9ET43 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cldn12Q9ET43 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cldn12Q9ET43 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cldn12Q9ET43 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn12Q9ET43 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn12Q9ET43 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn12Q9ET43 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn12Q9ET43 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn12Q9ET43 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn12Q9ET43 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn12Q9ET43 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn12Q9ET43 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn12Q9ET43 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn12Q9ET43 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn12Q9ET43 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn12Q9ET43 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn12Q9ET43 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn12Q9ET43 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn12Q9ET43 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn12Q9ET43 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn12Q9ET43 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn12Q9ET43 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn12Q9ET43 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn12Q9ET43 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn12Q9ET43 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn12Q9ET43 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn12Q9ET43 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn12Q9ET43 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn12Q9ET43 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn12Q9ET43 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn12Q9ET43 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms