Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ush1cQ9ES64 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ush1cQ9ES64 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ush1cQ9ES64 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ush1cQ9ES64 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ush1cQ9ES64 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ush1cQ9ES64 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ush1cQ9ES64 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ush1cQ9ES64 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ush1cQ9ES64 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ush1cQ9ES64 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ush1cQ9ES64 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ush1cQ9ES64 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ush1cQ9ES64 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ush1cQ9ES64 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ush1cQ9ES64 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ush1cQ9ES64 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ush1cQ9ES64 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ush1cQ9ES64 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ush1cQ9ES64 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ush1cQ9ES64 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ush1cQ9ES64 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ush1cQ9ES64 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ush1cQ9ES64 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ush1cQ9ES64 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ush1cQ9ES64 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ush1cQ9ES64 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ush1cQ9ES64 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ush1cQ9ES64 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ush1cQ9ES64 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ush1cQ9ES64 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ush1cQ9ES64 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ush1cQ9ES64 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ush1cQ9ES64 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ush1cQ9ES64 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ush1cQ9ES64 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ush1cQ9ES64 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ush1cQ9ES64 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ush1cQ9ES64 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ush1cQ9ES64 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ush1cQ9ES64 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ush1cQ9ES64 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ush1cQ9ES64 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ush1cQ9ES64 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ush1cQ9ES64 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ush1cQ9ES64 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ush1cQ9ES64 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ush1cQ9ES64 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ush1cQ9ES64 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ush1cQ9ES64 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ush1cQ9ES64 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ush1cQ9ES64 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ush1cQ9ES64 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ush1cQ9ES64 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ush1cQ9ES64 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ush1cQ9ES64 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ush1cQ9ES64 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ush1cQ9ES64 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ush1cQ9ES64 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ush1cQ9ES64 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ush1cQ9ES64 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ush1cQ9ES64 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ush1cQ9ES64 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ush1cQ9ES64 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ush1cQ9ES64 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ush1cQ9ES64 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ush1cQ9ES64 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ush1cQ9ES64 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ush1cQ9ES64 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ush1cQ9ES64 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ush1cQ9ES64 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ush1cQ9ES64 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ush1cQ9ES64 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ush1cQ9ES64 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ush1cQ9ES64 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ush1cQ9ES64 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ush1cQ9ES64 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ush1cQ9ES64 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ush1cQ9ES64 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ush1cQ9ES64 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ush1cQ9ES64 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ush1cQ9ES64 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ush1cQ9ES64 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ush1cQ9ES64 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ush1cQ9ES64 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ush1cQ9ES64 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ush1cQ9ES64 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ush1cQ9ES64 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ush1cQ9ES64 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ush1cQ9ES64 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ush1cQ9ES64 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ush1cQ9ES64 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ush1cQ9ES64 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ush1cQ9ES64 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ush1cQ9ES64 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ush1cQ9ES64 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ush1cQ9ES64 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ush1cQ9ES64 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ush1cQ9ES64 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ush1cQ9ES64 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms