Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Clstn2Q9ER65 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Clstn2Q9ER65 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Clstn2Q9ER65 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Clstn2Q9ER65 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Clstn2Q9ER65 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Clstn2Q9ER65 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Clstn2Q9ER65 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Clstn2Q9ER65 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Clstn2Q9ER65 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Clstn2Q9ER65 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Clstn2Q9ER65 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Clstn2Q9ER65 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Clstn2Q9ER65 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Clstn2Q9ER65 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Clstn2Q9ER65 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Clstn2Q9ER65 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Clstn2Q9ER65 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Clstn2Q9ER65 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Clstn2Q9ER65 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Clstn2Q9ER65 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Clstn2Q9ER65 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Clstn2Q9ER65 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Clstn2Q9ER65 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Clstn2Q9ER65 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Clstn2Q9ER65 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Clstn2Q9ER65 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Clstn2Q9ER65 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Clstn2Q9ER65 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Clstn2Q9ER65 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Clstn2Q9ER65 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Clstn2Q9ER65 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
Clstn2Q9ER65 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Clstn2Q9ER65 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Clstn2Q9ER65 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Clstn2Q9ER65 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Clstn2Q9ER65 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Clstn2Q9ER65 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Clstn2Q9ER65 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Clstn2Q9ER65 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Clstn2Q9ER65 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Clstn2Q9ER65 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Clstn2Q9ER65 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Clstn2Q9ER65 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Clstn2Q9ER65 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Clstn2Q9ER65 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Clstn2Q9ER65 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Clstn2Q9ER65 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Clstn2Q9ER65 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Clstn2Q9ER65 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Clstn2Q9ER65 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Clstn2Q9ER65 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Clstn2Q9ER65 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Clstn2Q9ER65 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Clstn2Q9ER65 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Clstn2Q9ER65 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Clstn2Q9ER65 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Clstn2Q9ER65 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Clstn2Q9ER65 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Clstn2Q9ER65 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Clstn2Q9ER65 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Clstn2Q9ER65 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Clstn2Q9ER65 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Clstn2Q9ER65 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Clstn2Q9ER65 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Clstn2Q9ER65 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Clstn2Q9ER65 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Clstn2Q9ER65 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Clstn2Q9ER65 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Clstn2Q9ER65 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Clstn2Q9ER65 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Clstn2Q9ER65 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Clstn2Q9ER65 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Clstn2Q9ER65 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Clstn2Q9ER65 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Clstn2Q9ER65 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Clstn2Q9ER65 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Clstn2Q9ER65 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Clstn2Q9ER65 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Clstn2Q9ER65 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Clstn2Q9ER65 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Clstn2Q9ER65 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Clstn2Q9ER65 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Clstn2Q9ER65 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Clstn2Q9ER65 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Clstn2Q9ER65 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Clstn2Q9ER65 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Clstn2Q9ER65 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Clstn2Q9ER65 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Clstn2Q9ER65 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Clstn2Q9ER65 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Clstn2Q9ER65 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Clstn2Q9ER65 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Clstn2Q9ER65 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Clstn2Q9ER65 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Clstn2Q9ER65 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Clstn2Q9ER65 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Clstn2Q9ER65 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Clstn2Q9ER65 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Clstn2Q9ER65 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.8 ms