Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQN9

Slc19a2, Thiamine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc19a2Q9EQN9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc19a2Q9EQN9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc19a2Q9EQN9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc19a2Q9EQN9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc19a2Q9EQN9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc19a2Q9EQN9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Slc19a2Q9EQN9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Slc19a2Q9EQN9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Slc19a2Q9EQN9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Slc19a2Q9EQN9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc19a2Q9EQN9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc19a2Q9EQN9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc19a2Q9EQN9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc19a2Q9EQN9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc19a2Q9EQN9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc19a2Q9EQN9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc19a2Q9EQN9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc19a2Q9EQN9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Slc19a2Q9EQN9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc19a2Q9EQN9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc19a2Q9EQN9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc19a2Q9EQN9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc19a2Q9EQN9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc19a2Q9EQN9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc19a2Q9EQN9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc19a2Q9EQN9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc19a2Q9EQN9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Slc19a2Q9EQN9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc19a2Q9EQN9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Slc19a2Q9EQN9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc19a2Q9EQN9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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Slc19a2Q9EQN9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc19a2Q9EQN9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Slc19a2Q9EQN9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc19a2Q9EQN9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc19a2Q9EQN9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Slc19a2Q9EQN9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Slc19a2Q9EQN9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc19a2Q9EQN9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Slc19a2Q9EQN9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Slc19a2Q9EQN9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc19a2Q9EQN9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc19a2Q9EQN9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Slc19a2Q9EQN9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc19a2Q9EQN9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Slc19a2Q9EQN9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc19a2Q9EQN9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc19a2Q9EQN9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc19a2Q9EQN9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc19a2Q9EQN9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc19a2Q9EQN9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc19a2Q9EQN9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc19a2Q9EQN9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc19a2Q9EQN9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc19a2Q9EQN9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc19a2Q9EQN9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc19a2Q9EQN9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc19a2Q9EQN9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc19a2Q9EQN9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc19a2Q9EQN9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc19a2Q9EQN9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc19a2Q9EQN9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc19a2Q9EQN9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc19a2Q9EQN9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc19a2Q9EQN9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc19a2Q9EQN9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc19a2Q9EQN9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc19a2Q9EQN9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 229.7 ms