Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col4a3bpQ9EQG9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col4a3bpQ9EQG9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col4a3bpQ9EQG9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col4a3bpQ9EQG9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col4a3bpQ9EQG9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Col4a3bpQ9EQG9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col4a3bpQ9EQG9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col4a3bpQ9EQG9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col4a3bpQ9EQG9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col4a3bpQ9EQG9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col4a3bpQ9EQG9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col4a3bpQ9EQG9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col4a3bpQ9EQG9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col4a3bpQ9EQG9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col4a3bpQ9EQG9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Col4a3bpQ9EQG9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col4a3bpQ9EQG9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col4a3bpQ9EQG9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col4a3bpQ9EQG9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col4a3bpQ9EQG9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Col4a3bpQ9EQG9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Col4a3bpQ9EQG9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Col4a3bpQ9EQG9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col4a3bpQ9EQG9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col4a3bpQ9EQG9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col4a3bpQ9EQG9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col4a3bpQ9EQG9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col4a3bpQ9EQG9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col4a3bpQ9EQG9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col4a3bpQ9EQG9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col4a3bpQ9EQG9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Col4a3bpQ9EQG9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Col4a3bpQ9EQG9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Col4a3bpQ9EQG9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Col4a3bpQ9EQG9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col4a3bpQ9EQG9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col4a3bpQ9EQG9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col4a3bpQ9EQG9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col4a3bpQ9EQG9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col4a3bpQ9EQG9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col4a3bpQ9EQG9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col4a3bpQ9EQG9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col4a3bpQ9EQG9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col4a3bpQ9EQG9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col4a3bpQ9EQG9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col4a3bpQ9EQG9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col4a3bpQ9EQG9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col4a3bpQ9EQG9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col4a3bpQ9EQG9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col4a3bpQ9EQG9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col4a3bpQ9EQG9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col4a3bpQ9EQG9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col4a3bpQ9EQG9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col4a3bpQ9EQG9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col4a3bpQ9EQG9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col4a3bpQ9EQG9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col4a3bpQ9EQG9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col4a3bpQ9EQG9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col4a3bpQ9EQG9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col4a3bpQ9EQG9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col4a3bpQ9EQG9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col4a3bpQ9EQG9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col4a3bpQ9EQG9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Col4a3bpQ9EQG9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col4a3bpQ9EQG9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col4a3bpQ9EQG9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col4a3bpQ9EQG9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col4a3bpQ9EQG9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col4a3bpQ9EQG9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col4a3bpQ9EQG9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col4a3bpQ9EQG9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col4a3bpQ9EQG9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Col4a3bpQ9EQG9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Col4a3bpQ9EQG9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col4a3bpQ9EQG9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col4a3bpQ9EQG9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col4a3bpQ9EQG9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col4a3bpQ9EQG9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col4a3bpQ9EQG9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Col4a3bpQ9EQG9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col4a3bpQ9EQG9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col4a3bpQ9EQG9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col4a3bpQ9EQG9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col4a3bpQ9EQG9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col4a3bpQ9EQG9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col4a3bpQ9EQG9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col4a3bpQ9EQG9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col4a3bpQ9EQG9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col4a3bpQ9EQG9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Col4a3bpQ9EQG9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col4a3bpQ9EQG9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col4a3bpQ9EQG9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col4a3bpQ9EQG9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col4a3bpQ9EQG9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col4a3bpQ9EQG9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col4a3bpQ9EQG9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col4a3bpQ9EQG9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col4a3bpQ9EQG9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms