Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcr6Q9EQ16 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcr6Q9EQ16 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcr6Q9EQ16 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcr6Q9EQ16 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcr6Q9EQ16 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcr6Q9EQ16 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcr6Q9EQ16 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcr6Q9EQ16 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcr6Q9EQ16 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcr6Q9EQ16 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcr6Q9EQ16 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcr6Q9EQ16 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcr6Q9EQ16 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcr6Q9EQ16 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcr6Q9EQ16 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcr6Q9EQ16 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcr6Q9EQ16 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcr6Q9EQ16 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcr6Q9EQ16 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcr6Q9EQ16 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcr6Q9EQ16 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcr6Q9EQ16 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxcr6Q9EQ16 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxcr6Q9EQ16 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxcr6Q9EQ16 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxcr6Q9EQ16 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxcr6Q9EQ16 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxcr6Q9EQ16 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxcr6Q9EQ16 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxcr6Q9EQ16 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxcr6Q9EQ16 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxcr6Q9EQ16 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxcr6Q9EQ16 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxcr6Q9EQ16 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxcr6Q9EQ16 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxcr6Q9EQ16 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxcr6Q9EQ16 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cxcr6Q9EQ16 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cxcr6Q9EQ16 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cxcr6Q9EQ16 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cxcr6Q9EQ16 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cxcr6Q9EQ16 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cxcr6Q9EQ16 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cxcr6Q9EQ16 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcr6Q9EQ16 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcr6Q9EQ16 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxcr6Q9EQ16 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxcr6Q9EQ16 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcr6Q9EQ16 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcr6Q9EQ16 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcr6Q9EQ16 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcr6Q9EQ16 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcr6Q9EQ16 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcr6Q9EQ16 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcr6Q9EQ16 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcr6Q9EQ16 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcr6Q9EQ16 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcr6Q9EQ16 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcr6Q9EQ16 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcr6Q9EQ16 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcr6Q9EQ16 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcr6Q9EQ16 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcr6Q9EQ16 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcr6Q9EQ16 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcr6Q9EQ16 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcr6Q9EQ16 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcr6Q9EQ16 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcr6Q9EQ16 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcr6Q9EQ16 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcr6Q9EQ16 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcr6Q9EQ16 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcr6Q9EQ16 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcr6Q9EQ16 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcr6Q9EQ16 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcr6Q9EQ16 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcr6Q9EQ16 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcr6Q9EQ16 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcr6Q9EQ16 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcr6Q9EQ16 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcr6Q9EQ16 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcr6Q9EQ16 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcr6Q9EQ16 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcr6Q9EQ16 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcr6Q9EQ16 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcr6Q9EQ16 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcr6Q9EQ16 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcr6Q9EQ16 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcr6Q9EQ16 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcr6Q9EQ16 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcr6Q9EQ16 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcr6Q9EQ16 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcr6Q9EQ16 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcr6Q9EQ16 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcr6Q9EQ16 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcr6Q9EQ16 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcr6Q9EQ16 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcr6Q9EQ16 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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