Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SgshQ9EQ08 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SgshQ9EQ08 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SgshQ9EQ08 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SgshQ9EQ08 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SgshQ9EQ08 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SgshQ9EQ08 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SgshQ9EQ08 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SgshQ9EQ08 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SgshQ9EQ08 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SgshQ9EQ08 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SgshQ9EQ08 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SgshQ9EQ08 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SgshQ9EQ08 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SgshQ9EQ08 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SgshQ9EQ08 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SgshQ9EQ08 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SgshQ9EQ08 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SgshQ9EQ08 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SgshQ9EQ08 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SgshQ9EQ08 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SgshQ9EQ08 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SgshQ9EQ08 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SgshQ9EQ08 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SgshQ9EQ08 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SgshQ9EQ08 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SgshQ9EQ08 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SgshQ9EQ08 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SgshQ9EQ08 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SgshQ9EQ08 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SgshQ9EQ08 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SgshQ9EQ08 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SgshQ9EQ08 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SgshQ9EQ08 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SgshQ9EQ08 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SgshQ9EQ08 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SgshQ9EQ08 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SgshQ9EQ08 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SgshQ9EQ08 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SgshQ9EQ08 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SgshQ9EQ08 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SgshQ9EQ08 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SgshQ9EQ08 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SgshQ9EQ08 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SgshQ9EQ08 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SgshQ9EQ08 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SgshQ9EQ08 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SgshQ9EQ08 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SgshQ9EQ08 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SgshQ9EQ08 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SgshQ9EQ08 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SgshQ9EQ08 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SgshQ9EQ08 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SgshQ9EQ08 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SgshQ9EQ08 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SgshQ9EQ08 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SgshQ9EQ08 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SgshQ9EQ08 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SgshQ9EQ08 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SgshQ9EQ08 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms