Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK6

Sil1, Nucleotide exchange factor SIL1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sil1Q9EPK6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Sil1Q9EPK6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sil1Q9EPK6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sil1Q9EPK6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sil1Q9EPK6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Sil1Q9EPK6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sil1Q9EPK6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sil1Q9EPK6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sil1Q9EPK6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sil1Q9EPK6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sil1Q9EPK6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sil1Q9EPK6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sil1Q9EPK6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sil1Q9EPK6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sil1Q9EPK6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sil1Q9EPK6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sil1Q9EPK6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Sil1Q9EPK6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sil1Q9EPK6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sil1Q9EPK6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sil1Q9EPK6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sil1Q9EPK6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sil1Q9EPK6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sil1Q9EPK6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sil1Q9EPK6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sil1Q9EPK6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sil1Q9EPK6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sil1Q9EPK6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sil1Q9EPK6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sil1Q9EPK6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sil1Q9EPK6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Sil1Q9EPK6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sil1Q9EPK6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sil1Q9EPK6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sil1Q9EPK6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sil1Q9EPK6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sil1Q9EPK6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sil1Q9EPK6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Sil1Q9EPK6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sil1Q9EPK6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sil1Q9EPK6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sil1Q9EPK6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sil1Q9EPK6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Sil1Q9EPK6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sil1Q9EPK6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sil1Q9EPK6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sil1Q9EPK6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sil1Q9EPK6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sil1Q9EPK6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sil1Q9EPK6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sil1Q9EPK6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sil1Q9EPK6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sil1Q9EPK6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sil1Q9EPK6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Sil1Q9EPK6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sil1Q9EPK6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sil1Q9EPK6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sil1Q9EPK6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Sil1Q9EPK6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sil1Q9EPK6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sil1Q9EPK6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sil1Q9EPK6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sil1Q9EPK6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sil1Q9EPK6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sil1Q9EPK6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sil1Q9EPK6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Sil1Q9EPK6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sil1Q9EPK6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sil1Q9EPK6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sil1Q9EPK6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sil1Q9EPK6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sil1Q9EPK6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sil1Q9EPK6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sil1Q9EPK6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sil1Q9EPK6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sil1Q9EPK6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Sil1Q9EPK6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Sil1Q9EPK6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sil1Q9EPK6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sil1Q9EPK6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sil1Q9EPK6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sil1Q9EPK6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sil1Q9EPK6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sil1Q9EPK6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sil1Q9EPK6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sil1Q9EPK6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sil1Q9EPK6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sil1Q9EPK6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sil1Q9EPK6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sil1Q9EPK6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sil1Q9EPK6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sil1Q9EPK6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sil1Q9EPK6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sil1Q9EPK6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sil1Q9EPK6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sil1Q9EPK6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sil1Q9EPK6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sil1Q9EPK6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sil1Q9EPK6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sil1Q9EPK6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 183.7 ms