Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gpr88Q9EPB7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gpr88Q9EPB7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpr88Q9EPB7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpr88Q9EPB7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpr88Q9EPB7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpr88Q9EPB7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpr88Q9EPB7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpr88Q9EPB7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpr88Q9EPB7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpr88Q9EPB7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpr88Q9EPB7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpr88Q9EPB7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpr88Q9EPB7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpr88Q9EPB7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpr88Q9EPB7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gpr88Q9EPB7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gpr88Q9EPB7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gpr88Q9EPB7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gpr88Q9EPB7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpr88Q9EPB7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpr88Q9EPB7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpr88Q9EPB7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpr88Q9EPB7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpr88Q9EPB7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpr88Q9EPB7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpr88Q9EPB7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpr88Q9EPB7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpr88Q9EPB7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpr88Q9EPB7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpr88Q9EPB7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpr88Q9EPB7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpr88Q9EPB7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpr88Q9EPB7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpr88Q9EPB7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpr88Q9EPB7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpr88Q9EPB7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpr88Q9EPB7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpr88Q9EPB7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpr88Q9EPB7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpr88Q9EPB7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpr88Q9EPB7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpr88Q9EPB7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpr88Q9EPB7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpr88Q9EPB7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpr88Q9EPB7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpr88Q9EPB7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpr88Q9EPB7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpr88Q9EPB7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpr88Q9EPB7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpr88Q9EPB7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpr88Q9EPB7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpr88Q9EPB7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpr88Q9EPB7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpr88Q9EPB7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpr88Q9EPB7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpr88Q9EPB7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpr88Q9EPB7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpr88Q9EPB7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpr88Q9EPB7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpr88Q9EPB7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpr88Q9EPB7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpr88Q9EPB7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpr88Q9EPB7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpr88Q9EPB7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpr88Q9EPB7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpr88Q9EPB7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpr88Q9EPB7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpr88Q9EPB7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpr88Q9EPB7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpr88Q9EPB7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gpr88Q9EPB7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gpr88Q9EPB7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gpr88Q9EPB7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpr88Q9EPB7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpr88Q9EPB7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpr88Q9EPB7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpr88Q9EPB7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpr88Q9EPB7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpr88Q9EPB7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpr88Q9EPB7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpr88Q9EPB7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpr88Q9EPB7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpr88Q9EPB7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpr88Q9EPB7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpr88Q9EPB7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpr88Q9EPB7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpr88Q9EPB7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpr88Q9EPB7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpr88Q9EPB7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpr88Q9EPB7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpr88Q9EPB7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpr88Q9EPB7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpr88Q9EPB7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpr88Q9EPB7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpr88Q9EPB7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpr88Q9EPB7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpr88Q9EPB7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpr88Q9EPB7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpr88Q9EPB7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms