Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cyp27a1Q9DBG1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cyp27a1Q9DBG1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cyp27a1Q9DBG1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cyp27a1Q9DBG1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cyp27a1Q9DBG1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cyp27a1Q9DBG1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cyp27a1Q9DBG1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cyp27a1Q9DBG1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cyp27a1Q9DBG1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cyp27a1Q9DBG1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cyp27a1Q9DBG1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cyp27a1Q9DBG1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cyp27a1Q9DBG1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cyp27a1Q9DBG1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cyp27a1Q9DBG1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cyp27a1Q9DBG1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cyp27a1Q9DBG1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cyp27a1Q9DBG1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cyp27a1Q9DBG1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cyp27a1Q9DBG1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cyp27a1Q9DBG1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cyp27a1Q9DBG1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cyp27a1Q9DBG1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cyp27a1Q9DBG1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cyp27a1Q9DBG1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cyp27a1Q9DBG1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cyp27a1Q9DBG1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cyp27a1Q9DBG1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cyp27a1Q9DBG1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cyp27a1Q9DBG1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cyp27a1Q9DBG1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cyp27a1Q9DBG1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Cyp27a1Q9DBG1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cyp27a1Q9DBG1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Cyp27a1Q9DBG1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Cyp27a1Q9DBG1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cyp27a1Q9DBG1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cyp27a1Q9DBG1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cyp27a1Q9DBG1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cyp27a1Q9DBG1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cyp27a1Q9DBG1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Cyp27a1Q9DBG1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cyp27a1Q9DBG1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cyp27a1Q9DBG1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cyp27a1Q9DBG1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cyp27a1Q9DBG1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cyp27a1Q9DBG1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cyp27a1Q9DBG1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cyp27a1Q9DBG1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cyp27a1Q9DBG1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cyp27a1Q9DBG1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cyp27a1Q9DBG1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cyp27a1Q9DBG1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cyp27a1Q9DBG1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cyp27a1Q9DBG1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cyp27a1Q9DBG1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cyp27a1Q9DBG1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cyp27a1Q9DBG1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cyp27a1Q9DBG1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cyp27a1Q9DBG1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Cyp27a1Q9DBG1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cyp27a1Q9DBG1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cyp27a1Q9DBG1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cyp27a1Q9DBG1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cyp27a1Q9DBG1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Cyp27a1Q9DBG1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cyp27a1Q9DBG1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cyp27a1Q9DBG1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cyp27a1Q9DBG1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cyp27a1Q9DBG1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cyp27a1Q9DBG1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cyp27a1Q9DBG1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cyp27a1Q9DBG1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cyp27a1Q9DBG1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Cyp27a1Q9DBG1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cyp27a1Q9DBG1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cyp27a1Q9DBG1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cyp27a1Q9DBG1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cyp27a1Q9DBG1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cyp27a1Q9DBG1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cyp27a1Q9DBG1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cyp27a1Q9DBG1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cyp27a1Q9DBG1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cyp27a1Q9DBG1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cyp27a1Q9DBG1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cyp27a1Q9DBG1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cyp27a1Q9DBG1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cyp27a1Q9DBG1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cyp27a1Q9DBG1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cyp27a1Q9DBG1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cyp27a1Q9DBG1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cyp27a1Q9DBG1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cyp27a1Q9DBG1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cyp27a1Q9DBG1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cyp27a1Q9DBG1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cyp27a1Q9DBG1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms