Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cmtr1Q9DBC3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cmtr1Q9DBC3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cmtr1Q9DBC3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cmtr1Q9DBC3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cmtr1Q9DBC3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cmtr1Q9DBC3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cmtr1Q9DBC3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cmtr1Q9DBC3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cmtr1Q9DBC3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cmtr1Q9DBC3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cmtr1Q9DBC3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cmtr1Q9DBC3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cmtr1Q9DBC3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cmtr1Q9DBC3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cmtr1Q9DBC3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cmtr1Q9DBC3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cmtr1Q9DBC3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cmtr1Q9DBC3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cmtr1Q9DBC3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cmtr1Q9DBC3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cmtr1Q9DBC3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cmtr1Q9DBC3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cmtr1Q9DBC3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cmtr1Q9DBC3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cmtr1Q9DBC3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cmtr1Q9DBC3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cmtr1Q9DBC3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cmtr1Q9DBC3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cmtr1Q9DBC3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cmtr1Q9DBC3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cmtr1Q9DBC3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cmtr1Q9DBC3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cmtr1Q9DBC3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cmtr1Q9DBC3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cmtr1Q9DBC3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cmtr1Q9DBC3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cmtr1Q9DBC3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cmtr1Q9DBC3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cmtr1Q9DBC3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cmtr1Q9DBC3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cmtr1Q9DBC3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cmtr1Q9DBC3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cmtr1Q9DBC3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cmtr1Q9DBC3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cmtr1Q9DBC3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cmtr1Q9DBC3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cmtr1Q9DBC3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cmtr1Q9DBC3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cmtr1Q9DBC3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cmtr1Q9DBC3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cmtr1Q9DBC3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cmtr1Q9DBC3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cmtr1Q9DBC3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cmtr1Q9DBC3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cmtr1Q9DBC3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cmtr1Q9DBC3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cmtr1Q9DBC3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cmtr1Q9DBC3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cmtr1Q9DBC3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cmtr1Q9DBC3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cmtr1Q9DBC3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cmtr1Q9DBC3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cmtr1Q9DBC3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cmtr1Q9DBC3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cmtr1Q9DBC3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cmtr1Q9DBC3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cmtr1Q9DBC3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cmtr1Q9DBC3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cmtr1Q9DBC3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cmtr1Q9DBC3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cmtr1Q9DBC3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cmtr1Q9DBC3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cmtr1Q9DBC3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cmtr1Q9DBC3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cmtr1Q9DBC3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cmtr1Q9DBC3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cmtr1Q9DBC3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cmtr1Q9DBC3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cmtr1Q9DBC3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cmtr1Q9DBC3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cmtr1Q9DBC3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cmtr1Q9DBC3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cmtr1Q9DBC3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cmtr1Q9DBC3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cmtr1Q9DBC3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cmtr1Q9DBC3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cmtr1Q9DBC3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cmtr1Q9DBC3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cmtr1Q9DBC3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cmtr1Q9DBC3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cmtr1Q9DBC3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cmtr1Q9DBC3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cmtr1Q9DBC3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cmtr1Q9DBC3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cmtr1Q9DBC3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cmtr1Q9DBC3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cmtr1Q9DBC3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cmtr1Q9DBC3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cmtr1Q9DBC3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms