Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU9

Znf654, Zinc finger protein 654, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf654Q9DAU9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf654Q9DAU9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf654Q9DAU9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf654Q9DAU9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf654Q9DAU9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Znf654Q9DAU9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Znf654Q9DAU9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Znf654Q9DAU9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Znf654Q9DAU9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Znf654Q9DAU9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Znf654Q9DAU9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Znf654Q9DAU9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Znf654Q9DAU9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Znf654Q9DAU9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Znf654Q9DAU9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Znf654Q9DAU9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Znf654Q9DAU9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Znf654Q9DAU9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Znf654Q9DAU9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf654Q9DAU9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf654Q9DAU9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf654Q9DAU9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf654Q9DAU9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znf654Q9DAU9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znf654Q9DAU9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Znf654Q9DAU9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf654Q9DAU9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf654Q9DAU9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf654Q9DAU9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf654Q9DAU9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf654Q9DAU9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf654Q9DAU9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf654Q9DAU9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf654Q9DAU9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf654Q9DAU9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf654Q9DAU9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf654Q9DAU9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf654Q9DAU9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Znf654Q9DAU9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Znf654Q9DAU9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf654Q9DAU9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf654Q9DAU9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf654Q9DAU9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf654Q9DAU9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf654Q9DAU9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf654Q9DAU9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf654Q9DAU9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf654Q9DAU9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf654Q9DAU9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf654Q9DAU9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Znf654Q9DAU9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Znf654Q9DAU9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Znf654Q9DAU9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Znf654Q9DAU9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf654Q9DAU9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf654Q9DAU9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf654Q9DAU9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf654Q9DAU9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf654Q9DAU9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf654Q9DAU9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf654Q9DAU9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf654Q9DAU9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf654Q9DAU9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf654Q9DAU9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf654Q9DAU9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf654Q9DAU9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf654Q9DAU9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf654Q9DAU9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf654Q9DAU9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf654Q9DAU9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf654Q9DAU9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf654Q9DAU9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf654Q9DAU9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf654Q9DAU9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf654Q9DAU9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf654Q9DAU9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf654Q9DAU9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf654Q9DAU9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf654Q9DAU9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf654Q9DAU9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf654Q9DAU9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf654Q9DAU9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf654Q9DAU9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf654Q9DAU9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf654Q9DAU9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf654Q9DAU9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf654Q9DAU9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf654Q9DAU9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf654Q9DAU9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Znf654Q9DAU9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Znf654Q9DAU9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf654Q9DAU9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf654Q9DAU9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf654Q9DAU9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf654Q9DAU9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Znf654Q9DAU9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Znf654Q9DAU9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Znf654Q9DAU9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Znf654Q9DAU9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Znf654Q9DAU9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms