Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Asf1bQ9DAP7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Asf1bQ9DAP7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asf1bQ9DAP7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asf1bQ9DAP7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asf1bQ9DAP7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asf1bQ9DAP7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asf1bQ9DAP7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asf1bQ9DAP7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Asf1bQ9DAP7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Asf1bQ9DAP7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Asf1bQ9DAP7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Asf1bQ9DAP7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Asf1bQ9DAP7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Asf1bQ9DAP7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Asf1bQ9DAP7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Asf1bQ9DAP7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Asf1bQ9DAP7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Asf1bQ9DAP7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Asf1bQ9DAP7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Asf1bQ9DAP7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Asf1bQ9DAP7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Asf1bQ9DAP7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Asf1bQ9DAP7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Asf1bQ9DAP7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Asf1bQ9DAP7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Asf1bQ9DAP7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Asf1bQ9DAP7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Asf1bQ9DAP7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Asf1bQ9DAP7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Asf1bQ9DAP7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Asf1bQ9DAP7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Asf1bQ9DAP7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Asf1bQ9DAP7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Asf1bQ9DAP7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Asf1bQ9DAP7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Asf1bQ9DAP7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Asf1bQ9DAP7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Asf1bQ9DAP7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Asf1bQ9DAP7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Asf1bQ9DAP7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Asf1bQ9DAP7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Asf1bQ9DAP7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Asf1bQ9DAP7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Asf1bQ9DAP7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Asf1bQ9DAP7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Asf1bQ9DAP7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Asf1bQ9DAP7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Asf1bQ9DAP7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Asf1bQ9DAP7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Asf1bQ9DAP7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Asf1bQ9DAP7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Asf1bQ9DAP7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Asf1bQ9DAP7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Asf1bQ9DAP7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Asf1bQ9DAP7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Asf1bQ9DAP7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Asf1bQ9DAP7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Asf1bQ9DAP7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Asf1bQ9DAP7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Asf1bQ9DAP7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Asf1bQ9DAP7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Asf1bQ9DAP7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Asf1bQ9DAP7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Asf1bQ9DAP7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Asf1bQ9DAP7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Asf1bQ9DAP7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Asf1bQ9DAP7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Asf1bQ9DAP7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Asf1bQ9DAP7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Asf1bQ9DAP7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Asf1bQ9DAP7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Asf1bQ9DAP7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Asf1bQ9DAP7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Asf1bQ9DAP7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Asf1bQ9DAP7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Asf1bQ9DAP7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Asf1bQ9DAP7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Asf1bQ9DAP7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Asf1bQ9DAP7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Asf1bQ9DAP7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Asf1bQ9DAP7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Asf1bQ9DAP7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Asf1bQ9DAP7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Asf1bQ9DAP7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Asf1bQ9DAP7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Asf1bQ9DAP7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Asf1bQ9DAP7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Asf1bQ9DAP7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Asf1bQ9DAP7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Asf1bQ9DAP7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Asf1bQ9DAP7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Asf1bQ9DAP7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Asf1bQ9DAP7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Asf1bQ9DAP7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Asf1bQ9DAP7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Asf1bQ9DAP7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Asf1bQ9DAP7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Asf1bQ9DAP7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Asf1bQ9DAP7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms