Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z1

Knstrn, Small kinetochore-associated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KnstrnQ9D9Z1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KnstrnQ9D9Z1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KnstrnQ9D9Z1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KnstrnQ9D9Z1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KnstrnQ9D9Z1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KnstrnQ9D9Z1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KnstrnQ9D9Z1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KnstrnQ9D9Z1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KnstrnQ9D9Z1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KnstrnQ9D9Z1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KnstrnQ9D9Z1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KnstrnQ9D9Z1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KnstrnQ9D9Z1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KnstrnQ9D9Z1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KnstrnQ9D9Z1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KnstrnQ9D9Z1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KnstrnQ9D9Z1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
KnstrnQ9D9Z1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KnstrnQ9D9Z1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KnstrnQ9D9Z1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KnstrnQ9D9Z1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KnstrnQ9D9Z1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KnstrnQ9D9Z1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KnstrnQ9D9Z1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KnstrnQ9D9Z1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KnstrnQ9D9Z1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KnstrnQ9D9Z1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KnstrnQ9D9Z1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KnstrnQ9D9Z1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KnstrnQ9D9Z1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KnstrnQ9D9Z1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KnstrnQ9D9Z1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KnstrnQ9D9Z1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KnstrnQ9D9Z1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KnstrnQ9D9Z1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
KnstrnQ9D9Z1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
KnstrnQ9D9Z1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KnstrnQ9D9Z1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KnstrnQ9D9Z1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KnstrnQ9D9Z1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KnstrnQ9D9Z1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KnstrnQ9D9Z1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
KnstrnQ9D9Z1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KnstrnQ9D9Z1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KnstrnQ9D9Z1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KnstrnQ9D9Z1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KnstrnQ9D9Z1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
KnstrnQ9D9Z1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KnstrnQ9D9Z1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KnstrnQ9D9Z1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KnstrnQ9D9Z1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KnstrnQ9D9Z1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KnstrnQ9D9Z1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KnstrnQ9D9Z1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KnstrnQ9D9Z1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
KnstrnQ9D9Z1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KnstrnQ9D9Z1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KnstrnQ9D9Z1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KnstrnQ9D9Z1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KnstrnQ9D9Z1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KnstrnQ9D9Z1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
KnstrnQ9D9Z1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KnstrnQ9D9Z1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KnstrnQ9D9Z1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KnstrnQ9D9Z1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KnstrnQ9D9Z1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KnstrnQ9D9Z1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KnstrnQ9D9Z1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KnstrnQ9D9Z1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KnstrnQ9D9Z1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KnstrnQ9D9Z1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KnstrnQ9D9Z1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KnstrnQ9D9Z1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KnstrnQ9D9Z1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KnstrnQ9D9Z1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KnstrnQ9D9Z1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KnstrnQ9D9Z1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KnstrnQ9D9Z1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
KnstrnQ9D9Z1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KnstrnQ9D9Z1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KnstrnQ9D9Z1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KnstrnQ9D9Z1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KnstrnQ9D9Z1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KnstrnQ9D9Z1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
KnstrnQ9D9Z1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KnstrnQ9D9Z1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KnstrnQ9D9Z1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KnstrnQ9D9Z1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
KnstrnQ9D9Z1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KnstrnQ9D9Z1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KnstrnQ9D9Z1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KnstrnQ9D9Z1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KnstrnQ9D9Z1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KnstrnQ9D9Z1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KnstrnQ9D9Z1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KnstrnQ9D9Z1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KnstrnQ9D9Z1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
KnstrnQ9D9Z1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KnstrnQ9D9Z1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KnstrnQ9D9Z1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.6 ms