Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9P8

Llcfc1, LLLL and CFNLAS motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Llcfc1Q9D9P8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Llcfc1Q9D9P8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Llcfc1Q9D9P8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Llcfc1Q9D9P8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Llcfc1Q9D9P8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Llcfc1Q9D9P8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Llcfc1Q9D9P8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Llcfc1Q9D9P8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Llcfc1Q9D9P8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Llcfc1Q9D9P8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Llcfc1Q9D9P8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Llcfc1Q9D9P8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Llcfc1Q9D9P8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Llcfc1Q9D9P8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Llcfc1Q9D9P8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Llcfc1Q9D9P8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Llcfc1Q9D9P8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Llcfc1Q9D9P8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Llcfc1Q9D9P8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Llcfc1Q9D9P8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Llcfc1Q9D9P8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Llcfc1Q9D9P8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Llcfc1Q9D9P8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Llcfc1Q9D9P8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Llcfc1Q9D9P8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Llcfc1Q9D9P8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Llcfc1Q9D9P8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Llcfc1Q9D9P8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Llcfc1Q9D9P8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Llcfc1Q9D9P8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Llcfc1Q9D9P8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Llcfc1Q9D9P8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Llcfc1Q9D9P8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Llcfc1Q9D9P8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Llcfc1Q9D9P8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Llcfc1Q9D9P8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Llcfc1Q9D9P8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Llcfc1Q9D9P8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Llcfc1Q9D9P8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Llcfc1Q9D9P8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Llcfc1Q9D9P8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Llcfc1Q9D9P8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Llcfc1Q9D9P8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Llcfc1Q9D9P8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Llcfc1Q9D9P8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Llcfc1Q9D9P8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Llcfc1Q9D9P8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Llcfc1Q9D9P8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Llcfc1Q9D9P8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Llcfc1Q9D9P8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Llcfc1Q9D9P8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Llcfc1Q9D9P8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Llcfc1Q9D9P8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Llcfc1Q9D9P8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Llcfc1Q9D9P8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Llcfc1Q9D9P8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Llcfc1Q9D9P8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Llcfc1Q9D9P8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Llcfc1Q9D9P8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Llcfc1Q9D9P8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Llcfc1Q9D9P8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Llcfc1Q9D9P8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Llcfc1Q9D9P8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Llcfc1Q9D9P8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Llcfc1Q9D9P8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Llcfc1Q9D9P8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Llcfc1Q9D9P8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Llcfc1Q9D9P8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Llcfc1Q9D9P8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Llcfc1Q9D9P8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Llcfc1Q9D9P8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Llcfc1Q9D9P8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Llcfc1Q9D9P8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Llcfc1Q9D9P8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Llcfc1Q9D9P8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Llcfc1Q9D9P8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Llcfc1Q9D9P8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Llcfc1Q9D9P8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Llcfc1Q9D9P8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Llcfc1Q9D9P8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Llcfc1Q9D9P8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Llcfc1Q9D9P8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Llcfc1Q9D9P8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Llcfc1Q9D9P8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Llcfc1Q9D9P8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Llcfc1Q9D9P8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Llcfc1Q9D9P8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Llcfc1Q9D9P8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Llcfc1Q9D9P8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Llcfc1Q9D9P8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Llcfc1Q9D9P8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Llcfc1Q9D9P8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Llcfc1Q9D9P8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Llcfc1Q9D9P8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Llcfc1Q9D9P8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Llcfc1Q9D9P8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Llcfc1Q9D9P8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Llcfc1Q9D9P8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Llcfc1Q9D9P8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Llcfc1Q9D9P8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms