Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tspan17Q9D7W4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tspan17Q9D7W4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tspan17Q9D7W4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tspan17Q9D7W4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tspan17Q9D7W4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tspan17Q9D7W4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tspan17Q9D7W4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tspan17Q9D7W4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tspan17Q9D7W4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tspan17Q9D7W4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tspan17Q9D7W4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tspan17Q9D7W4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tspan17Q9D7W4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tspan17Q9D7W4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tspan17Q9D7W4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tspan17Q9D7W4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tspan17Q9D7W4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tspan17Q9D7W4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tspan17Q9D7W4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tspan17Q9D7W4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Tspan17Q9D7W4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tspan17Q9D7W4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tspan17Q9D7W4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tspan17Q9D7W4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tspan17Q9D7W4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tspan17Q9D7W4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tspan17Q9D7W4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tspan17Q9D7W4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tspan17Q9D7W4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tspan17Q9D7W4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tspan17Q9D7W4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tspan17Q9D7W4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tspan17Q9D7W4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tspan17Q9D7W4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tspan17Q9D7W4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tspan17Q9D7W4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tspan17Q9D7W4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tspan17Q9D7W4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tspan17Q9D7W4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tspan17Q9D7W4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Tspan17Q9D7W4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tspan17Q9D7W4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tspan17Q9D7W4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tspan17Q9D7W4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tspan17Q9D7W4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tspan17Q9D7W4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tspan17Q9D7W4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tspan17Q9D7W4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tspan17Q9D7W4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tspan17Q9D7W4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tspan17Q9D7W4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tspan17Q9D7W4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tspan17Q9D7W4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tspan17Q9D7W4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tspan17Q9D7W4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tspan17Q9D7W4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tspan17Q9D7W4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tspan17Q9D7W4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tspan17Q9D7W4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tspan17Q9D7W4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tspan17Q9D7W4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tspan17Q9D7W4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tspan17Q9D7W4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tspan17Q9D7W4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tspan17Q9D7W4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tspan17Q9D7W4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tspan17Q9D7W4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tspan17Q9D7W4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tspan17Q9D7W4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tspan17Q9D7W4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tspan17Q9D7W4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tspan17Q9D7W4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tspan17Q9D7W4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tspan17Q9D7W4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tspan17Q9D7W4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tspan17Q9D7W4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tspan17Q9D7W4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tspan17Q9D7W4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tspan17Q9D7W4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tspan17Q9D7W4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tspan17Q9D7W4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tspan17Q9D7W4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tspan17Q9D7W4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tspan17Q9D7W4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tspan17Q9D7W4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tspan17Q9D7W4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tspan17Q9D7W4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tspan17Q9D7W4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tspan17Q9D7W4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tspan17Q9D7W4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tspan17Q9D7W4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tspan17Q9D7W4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tspan17Q9D7W4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tspan17Q9D7W4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tspan17Q9D7W4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tspan17Q9D7W4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tspan17Q9D7W4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tspan17Q9D7W4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tspan17Q9D7W4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms