Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nop56Q9D6Z1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nop56Q9D6Z1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
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