Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc52a3Q9D6X5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc52a3Q9D6X5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc52a3Q9D6X5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc52a3Q9D6X5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc52a3Q9D6X5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc52a3Q9D6X5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc52a3Q9D6X5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc52a3Q9D6X5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc52a3Q9D6X5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc52a3Q9D6X5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc52a3Q9D6X5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc52a3Q9D6X5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc52a3Q9D6X5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc52a3Q9D6X5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc52a3Q9D6X5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc52a3Q9D6X5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc52a3Q9D6X5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc52a3Q9D6X5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc52a3Q9D6X5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc52a3Q9D6X5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc52a3Q9D6X5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc52a3Q9D6X5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc52a3Q9D6X5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc52a3Q9D6X5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc52a3Q9D6X5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc52a3Q9D6X5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc52a3Q9D6X5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc52a3Q9D6X5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc52a3Q9D6X5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc52a3Q9D6X5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc52a3Q9D6X5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc52a3Q9D6X5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc52a3Q9D6X5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc52a3Q9D6X5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc52a3Q9D6X5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc52a3Q9D6X5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc52a3Q9D6X5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc52a3Q9D6X5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc52a3Q9D6X5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc52a3Q9D6X5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc52a3Q9D6X5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc52a3Q9D6X5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc52a3Q9D6X5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc52a3Q9D6X5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc52a3Q9D6X5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc52a3Q9D6X5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc52a3Q9D6X5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc52a3Q9D6X5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc52a3Q9D6X5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc52a3Q9D6X5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc52a3Q9D6X5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc52a3Q9D6X5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc52a3Q9D6X5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc52a3Q9D6X5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc52a3Q9D6X5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc52a3Q9D6X5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc52a3Q9D6X5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Slc52a3Q9D6X5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Slc52a3Q9D6X5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc52a3Q9D6X5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc52a3Q9D6X5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc52a3Q9D6X5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc52a3Q9D6X5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc52a3Q9D6X5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc52a3Q9D6X5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc52a3Q9D6X5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc52a3Q9D6X5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc52a3Q9D6X5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc52a3Q9D6X5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc52a3Q9D6X5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc52a3Q9D6X5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc52a3Q9D6X5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc52a3Q9D6X5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc52a3Q9D6X5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc52a3Q9D6X5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc52a3Q9D6X5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc52a3Q9D6X5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc52a3Q9D6X5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc52a3Q9D6X5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc52a3Q9D6X5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc52a3Q9D6X5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc52a3Q9D6X5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc52a3Q9D6X5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc52a3Q9D6X5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc52a3Q9D6X5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc52a3Q9D6X5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc52a3Q9D6X5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc52a3Q9D6X5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc52a3Q9D6X5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc52a3Q9D6X5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc52a3Q9D6X5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc52a3Q9D6X5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc52a3Q9D6X5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc52a3Q9D6X5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc52a3Q9D6X5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc52a3Q9D6X5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc52a3Q9D6X5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc52a3Q9D6X5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc52a3Q9D6X5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms