Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zcchc13Q9D548 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zcchc13Q9D548 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zcchc13Q9D548 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zcchc13Q9D548 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zcchc13Q9D548 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zcchc13Q9D548 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zcchc13Q9D548 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zcchc13Q9D548 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zcchc13Q9D548 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zcchc13Q9D548 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zcchc13Q9D548 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zcchc13Q9D548 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zcchc13Q9D548 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Zcchc13Q9D548 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zcchc13Q9D548 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zcchc13Q9D548 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zcchc13Q9D548 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zcchc13Q9D548 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zcchc13Q9D548 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zcchc13Q9D548 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zcchc13Q9D548 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zcchc13Q9D548 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zcchc13Q9D548 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zcchc13Q9D548 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zcchc13Q9D548 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zcchc13Q9D548 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zcchc13Q9D548 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zcchc13Q9D548 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zcchc13Q9D548 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zcchc13Q9D548 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zcchc13Q9D548 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zcchc13Q9D548 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zcchc13Q9D548 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zcchc13Q9D548 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zcchc13Q9D548 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Zcchc13Q9D548 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Zcchc13Q9D548 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Zcchc13Q9D548 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Zcchc13Q9D548 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zcchc13Q9D548 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zcchc13Q9D548 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zcchc13Q9D548 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zcchc13Q9D548 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zcchc13Q9D548 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zcchc13Q9D548 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zcchc13Q9D548 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zcchc13Q9D548 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zcchc13Q9D548 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zcchc13Q9D548 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zcchc13Q9D548 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zcchc13Q9D548 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zcchc13Q9D548 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zcchc13Q9D548 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zcchc13Q9D548 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zcchc13Q9D548 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Zcchc13Q9D548 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zcchc13Q9D548 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zcchc13Q9D548 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zcchc13Q9D548 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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