Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam227bQ9D518 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam227bQ9D518 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam227bQ9D518 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam227bQ9D518 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam227bQ9D518 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam227bQ9D518 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam227bQ9D518 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam227bQ9D518 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam227bQ9D518 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam227bQ9D518 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam227bQ9D518 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam227bQ9D518 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam227bQ9D518 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam227bQ9D518 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam227bQ9D518 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam227bQ9D518 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam227bQ9D518 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam227bQ9D518 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam227bQ9D518 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam227bQ9D518 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam227bQ9D518 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam227bQ9D518 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam227bQ9D518 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam227bQ9D518 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam227bQ9D518 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam227bQ9D518 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam227bQ9D518 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam227bQ9D518 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam227bQ9D518 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam227bQ9D518 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam227bQ9D518 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam227bQ9D518 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam227bQ9D518 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fam227bQ9D518 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam227bQ9D518 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam227bQ9D518 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam227bQ9D518 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam227bQ9D518 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam227bQ9D518 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam227bQ9D518 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam227bQ9D518 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam227bQ9D518 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam227bQ9D518 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam227bQ9D518 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam227bQ9D518 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam227bQ9D518 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam227bQ9D518 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam227bQ9D518 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam227bQ9D518 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam227bQ9D518 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam227bQ9D518 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam227bQ9D518 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam227bQ9D518 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam227bQ9D518 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam227bQ9D518 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam227bQ9D518 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam227bQ9D518 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam227bQ9D518 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam227bQ9D518 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam227bQ9D518 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam227bQ9D518 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam227bQ9D518 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam227bQ9D518 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam227bQ9D518 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam227bQ9D518 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam227bQ9D518 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam227bQ9D518 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam227bQ9D518 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam227bQ9D518 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam227bQ9D518 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam227bQ9D518 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam227bQ9D518 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam227bQ9D518 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam227bQ9D518 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam227bQ9D518 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam227bQ9D518 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam227bQ9D518 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam227bQ9D518 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam227bQ9D518 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam227bQ9D518 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam227bQ9D518 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam227bQ9D518 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam227bQ9D518 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam227bQ9D518 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam227bQ9D518 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam227bQ9D518 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam227bQ9D518 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam227bQ9D518 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam227bQ9D518 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam227bQ9D518 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam227bQ9D518 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam227bQ9D518 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam227bQ9D518 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam227bQ9D518 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fam227bQ9D518 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam227bQ9D518 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam227bQ9D518 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam227bQ9D518 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam227bQ9D518 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms