Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PrameQ9D4Z5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PrameQ9D4Z5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PrameQ9D4Z5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PrameQ9D4Z5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrameQ9D4Z5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrameQ9D4Z5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrameQ9D4Z5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrameQ9D4Z5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrameQ9D4Z5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrameQ9D4Z5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrameQ9D4Z5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PrameQ9D4Z5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PrameQ9D4Z5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PrameQ9D4Z5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PrameQ9D4Z5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PrameQ9D4Z5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PrameQ9D4Z5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrameQ9D4Z5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrameQ9D4Z5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrameQ9D4Z5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrameQ9D4Z5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrameQ9D4Z5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrameQ9D4Z5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrameQ9D4Z5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrameQ9D4Z5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PrameQ9D4Z5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PrameQ9D4Z5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PrameQ9D4Z5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PrameQ9D4Z5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PrameQ9D4Z5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PrameQ9D4Z5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PrameQ9D4Z5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PrameQ9D4Z5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PrameQ9D4Z5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PrameQ9D4Z5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PrameQ9D4Z5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PrameQ9D4Z5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PrameQ9D4Z5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrameQ9D4Z5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrameQ9D4Z5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrameQ9D4Z5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrameQ9D4Z5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrameQ9D4Z5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrameQ9D4Z5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrameQ9D4Z5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrameQ9D4Z5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PrameQ9D4Z5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrameQ9D4Z5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrameQ9D4Z5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrameQ9D4Z5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrameQ9D4Z5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PrameQ9D4Z5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PrameQ9D4Z5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PrameQ9D4Z5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PrameQ9D4Z5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PrameQ9D4Z5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PrameQ9D4Z5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PrameQ9D4Z5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PrameQ9D4Z5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PrameQ9D4Z5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PrameQ9D4Z5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PrameQ9D4Z5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PrameQ9D4Z5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PrameQ9D4Z5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PrameQ9D4Z5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PrameQ9D4Z5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PrameQ9D4Z5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PrameQ9D4Z5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PrameQ9D4Z5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PrameQ9D4Z5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PrameQ9D4Z5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PrameQ9D4Z5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PrameQ9D4Z5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrameQ9D4Z5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrameQ9D4Z5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrameQ9D4Z5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrameQ9D4Z5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PrameQ9D4Z5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PrameQ9D4Z5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PrameQ9D4Z5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PrameQ9D4Z5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PrameQ9D4Z5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PrameQ9D4Z5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PrameQ9D4Z5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PrameQ9D4Z5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PrameQ9D4Z5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PrameQ9D4Z5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PrameQ9D4Z5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrameQ9D4Z5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrameQ9D4Z5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrameQ9D4Z5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrameQ9D4Z5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrameQ9D4Z5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrameQ9D4Z5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrameQ9D4Z5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrameQ9D4Z5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrameQ9D4Z5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrameQ9D4Z5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrameQ9D4Z5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms