Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4931428L18RikQ9D4S9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4931428L18RikQ9D4S9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4931428L18RikQ9D4S9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
4931428L18RikQ9D4S9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4931428L18RikQ9D4S9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4931428L18RikQ9D4S9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
4931428L18RikQ9D4S9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4931428L18RikQ9D4S9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
4931428L18RikQ9D4S9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
4931428L18RikQ9D4S9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
4931428L18RikQ9D4S9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4931428L18RikQ9D4S9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
4931428L18RikQ9D4S9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4931428L18RikQ9D4S9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
4931428L18RikQ9D4S9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4931428L18RikQ9D4S9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
4931428L18RikQ9D4S9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4931428L18RikQ9D4S9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4931428L18RikQ9D4S9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4931428L18RikQ9D4S9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
4931428L18RikQ9D4S9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4931428L18RikQ9D4S9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4931428L18RikQ9D4S9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
4931428L18RikQ9D4S9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
4931428L18RikQ9D4S9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
4931428L18RikQ9D4S9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4931428L18RikQ9D4S9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4931428L18RikQ9D4S9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4931428L18RikQ9D4S9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931428L18RikQ9D4S9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931428L18RikQ9D4S9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931428L18RikQ9D4S9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931428L18RikQ9D4S9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931428L18RikQ9D4S9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931428L18RikQ9D4S9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931428L18RikQ9D4S9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931428L18RikQ9D4S9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931428L18RikQ9D4S9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931428L18RikQ9D4S9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931428L18RikQ9D4S9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
4931428L18RikQ9D4S9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931428L18RikQ9D4S9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931428L18RikQ9D4S9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
4931428L18RikQ9D4S9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931428L18RikQ9D4S9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931428L18RikQ9D4S9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931428L18RikQ9D4S9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931428L18RikQ9D4S9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931428L18RikQ9D4S9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931428L18RikQ9D4S9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
4931428L18RikQ9D4S9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931428L18RikQ9D4S9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931428L18RikQ9D4S9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931428L18RikQ9D4S9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931428L18RikQ9D4S9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
4931428L18RikQ9D4S9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
4931428L18RikQ9D4S9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4931428L18RikQ9D4S9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
4931428L18RikQ9D4S9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4931428L18RikQ9D4S9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
4931428L18RikQ9D4S9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4931428L18RikQ9D4S9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4931428L18RikQ9D4S9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4931428L18RikQ9D4S9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4931428L18RikQ9D4S9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
4931428L18RikQ9D4S9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4931428L18RikQ9D4S9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4931428L18RikQ9D4S9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4931428L18RikQ9D4S9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
4931428L18RikQ9D4S9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4931428L18RikQ9D4S9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4931428L18RikQ9D4S9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4931428L18RikQ9D4S9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4931428L18RikQ9D4S9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4931428L18RikQ9D4S9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4931428L18RikQ9D4S9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4931428L18RikQ9D4S9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4931428L18RikQ9D4S9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4931428L18RikQ9D4S9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4931428L18RikQ9D4S9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4931428L18RikQ9D4S9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4931428L18RikQ9D4S9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4931428L18RikQ9D4S9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4931428L18RikQ9D4S9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4931428L18RikQ9D4S9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4931428L18RikQ9D4S9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4931428L18RikQ9D4S9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4931428L18RikQ9D4S9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4931428L18RikQ9D4S9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4931428L18RikQ9D4S9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
4931428L18RikQ9D4S9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
4931428L18RikQ9D4S9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
4931428L18RikQ9D4S9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4931428L18RikQ9D4S9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4931428L18RikQ9D4S9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms