Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930564D02RikQ9D4S4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930564D02RikQ9D4S4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930564D02RikQ9D4S4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930564D02RikQ9D4S4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930564D02RikQ9D4S4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930564D02RikQ9D4S4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930564D02RikQ9D4S4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930564D02RikQ9D4S4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930564D02RikQ9D4S4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930564D02RikQ9D4S4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930564D02RikQ9D4S4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930564D02RikQ9D4S4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930564D02RikQ9D4S4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930564D02RikQ9D4S4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930564D02RikQ9D4S4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930564D02RikQ9D4S4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930564D02RikQ9D4S4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930564D02RikQ9D4S4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930564D02RikQ9D4S4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930564D02RikQ9D4S4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930564D02RikQ9D4S4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930564D02RikQ9D4S4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930564D02RikQ9D4S4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930564D02RikQ9D4S4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930564D02RikQ9D4S4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930564D02RikQ9D4S4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930564D02RikQ9D4S4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930564D02RikQ9D4S4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930564D02RikQ9D4S4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930564D02RikQ9D4S4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930564D02RikQ9D4S4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930564D02RikQ9D4S4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930564D02RikQ9D4S4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930564D02RikQ9D4S4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930564D02RikQ9D4S4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930564D02RikQ9D4S4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930564D02RikQ9D4S4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930564D02RikQ9D4S4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930564D02RikQ9D4S4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930564D02RikQ9D4S4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930564D02RikQ9D4S4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930564D02RikQ9D4S4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930564D02RikQ9D4S4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930564D02RikQ9D4S4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
4930564D02RikQ9D4S4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
4930564D02RikQ9D4S4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930564D02RikQ9D4S4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930564D02RikQ9D4S4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930564D02RikQ9D4S4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930564D02RikQ9D4S4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930564D02RikQ9D4S4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930564D02RikQ9D4S4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930564D02RikQ9D4S4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930564D02RikQ9D4S4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930564D02RikQ9D4S4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930564D02RikQ9D4S4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930564D02RikQ9D4S4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930564D02RikQ9D4S4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930564D02RikQ9D4S4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930564D02RikQ9D4S4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
4930564D02RikQ9D4S4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930564D02RikQ9D4S4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930564D02RikQ9D4S4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930564D02RikQ9D4S4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930564D02RikQ9D4S4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930564D02RikQ9D4S4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930564D02RikQ9D4S4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930564D02RikQ9D4S4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930564D02RikQ9D4S4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930564D02RikQ9D4S4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930564D02RikQ9D4S4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930564D02RikQ9D4S4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
4930564D02RikQ9D4S4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930564D02RikQ9D4S4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930564D02RikQ9D4S4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930564D02RikQ9D4S4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930564D02RikQ9D4S4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930564D02RikQ9D4S4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930564D02RikQ9D4S4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930564D02RikQ9D4S4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
4930564D02RikQ9D4S4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930564D02RikQ9D4S4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930564D02RikQ9D4S4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930564D02RikQ9D4S4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930564D02RikQ9D4S4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930564D02RikQ9D4S4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930564D02RikQ9D4S4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930564D02RikQ9D4S4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
4930564D02RikQ9D4S4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930564D02RikQ9D4S4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930564D02RikQ9D4S4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930564D02RikQ9D4S4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930564D02RikQ9D4S4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930564D02RikQ9D4S4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930564D02RikQ9D4S4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930564D02RikQ9D4S4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
4930564D02RikQ9D4S4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms