Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
4931423N10RikQ9D4J9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
4931423N10RikQ9D4J9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
4931423N10RikQ9D4J9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
4931423N10RikQ9D4J9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
4931423N10RikQ9D4J9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
4931423N10RikQ9D4J9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
4931423N10RikQ9D4J9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
4931423N10RikQ9D4J9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4931423N10RikQ9D4J9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
4931423N10RikQ9D4J9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
4931423N10RikQ9D4J9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
4931423N10RikQ9D4J9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4931423N10RikQ9D4J9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4931423N10RikQ9D4J9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
4931423N10RikQ9D4J9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4931423N10RikQ9D4J9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4931423N10RikQ9D4J9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4931423N10RikQ9D4J9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4931423N10RikQ9D4J9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4931423N10RikQ9D4J9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4931423N10RikQ9D4J9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
4931423N10RikQ9D4J9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4931423N10RikQ9D4J9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4931423N10RikQ9D4J9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4931423N10RikQ9D4J9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4931423N10RikQ9D4J9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4931423N10RikQ9D4J9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
4931423N10RikQ9D4J9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4931423N10RikQ9D4J9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
4931423N10RikQ9D4J9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
4931423N10RikQ9D4J9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
4931423N10RikQ9D4J9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4931423N10RikQ9D4J9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
4931423N10RikQ9D4J9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
4931423N10RikQ9D4J9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
4931423N10RikQ9D4J9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4931423N10RikQ9D4J9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
4931423N10RikQ9D4J9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4931423N10RikQ9D4J9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4931423N10RikQ9D4J9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
4931423N10RikQ9D4J9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
4931423N10RikQ9D4J9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4931423N10RikQ9D4J9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4931423N10RikQ9D4J9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4931423N10RikQ9D4J9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4931423N10RikQ9D4J9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4931423N10RikQ9D4J9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4931423N10RikQ9D4J9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
4931423N10RikQ9D4J9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
4931423N10RikQ9D4J9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4931423N10RikQ9D4J9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
4931423N10RikQ9D4J9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4931423N10RikQ9D4J9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
4931423N10RikQ9D4J9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4931423N10RikQ9D4J9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4931423N10RikQ9D4J9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4931423N10RikQ9D4J9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4931423N10RikQ9D4J9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4931423N10RikQ9D4J9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4931423N10RikQ9D4J9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4931423N10RikQ9D4J9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
4931423N10RikQ9D4J9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
4931423N10RikQ9D4J9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
4931423N10RikQ9D4J9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
4931423N10RikQ9D4J9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
4931423N10RikQ9D4J9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
4931423N10RikQ9D4J9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
4931423N10RikQ9D4J9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
4931423N10RikQ9D4J9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
4931423N10RikQ9D4J9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
4931423N10RikQ9D4J9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
4931423N10RikQ9D4J9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
4931423N10RikQ9D4J9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4931423N10RikQ9D4J9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4931423N10RikQ9D4J9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
4931423N10RikQ9D4J9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4931423N10RikQ9D4J9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4931423N10RikQ9D4J9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4931423N10RikQ9D4J9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4931423N10RikQ9D4J9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
4931423N10RikQ9D4J9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4931423N10RikQ9D4J9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4931423N10RikQ9D4J9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
4931423N10RikQ9D4J9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4931423N10RikQ9D4J9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4931423N10RikQ9D4J9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4931423N10RikQ9D4J9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4931423N10RikQ9D4J9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4931423N10RikQ9D4J9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
4931423N10RikQ9D4J9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4931423N10RikQ9D4J9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
4931423N10RikQ9D4J9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4931423N10RikQ9D4J9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4931423N10RikQ9D4J9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4931423N10RikQ9D4J9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms